Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RYR3Q15413 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RYR3Q15413 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RYR3Q15413 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RYR3Q15413 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RYR3Q15413 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RYR3Q15413 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RYR3Q15413 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RYR3Q15413 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RYR3Q15413 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RYR3Q15413 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
RYR3Q15413 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
RYR3Q15413 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RYR3Q15413 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RYR3Q15413 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RYR3Q15413 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RYR3Q15413 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RYR3Q15413 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RYR3Q15413 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RYR3Q15413 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RYR3Q15413 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RYR3Q15413 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
RYR3Q15413 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
RYR3Q15413 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
RYR3Q15413 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
RYR3Q15413 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
RYR3Q15413 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
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