Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DDX39BQ13838 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DDX39BQ13838 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DDX39BQ13838 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DDX39BQ13838 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DDX39BQ13838 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DDX39BQ13838 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DDX39BQ13838 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DDX39BQ13838 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DDX39BQ13838 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DDX39BQ13838 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DDX39BQ13838 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DDX39BQ13838 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DDX39BQ13838 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DDX39BQ13838 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DDX39BQ13838 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DDX39BQ13838 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DDX39BQ13838 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DDX39BQ13838 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DDX39BQ13838 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DDX39BQ13838 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DDX39BQ13838 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DDX39BQ13838 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DDX39BQ13838 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DDX39BQ13838 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DDX39BQ13838 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DDX39BQ13838 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DDX39BQ13838 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DDX39BQ13838 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DDX39BQ13838 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DDX39BQ13838 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DDX39BQ13838 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DDX39BQ13838 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DDX39BQ13838 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DDX39BQ13838 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DDX39BQ13838 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DDX39BQ13838 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DDX39BQ13838 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DDX39BQ13838 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DDX39BQ13838 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DDX39BQ13838 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DDX39BQ13838 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DDX39BQ13838 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DDX39BQ13838 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DDX39BQ13838 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DDX39BQ13838 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DDX39BQ13838 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DDX39BQ13838 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DDX39BQ13838 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DDX39BQ13838 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DDX39BQ13838 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DDX39BQ13838 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DDX39BQ13838 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DDX39BQ13838 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DDX39BQ13838 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DDX39BQ13838 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DDX39BQ13838 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DDX39BQ13838 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DDX39BQ13838 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DDX39BQ13838 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DDX39BQ13838 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DDX39BQ13838 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DDX39BQ13838 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DDX39BQ13838 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DDX39BQ13838 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDX39BQ13838 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDX39BQ13838 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDX39BQ13838 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDX39BQ13838 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDX39BQ13838 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDX39BQ13838 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDX39BQ13838 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDX39BQ13838 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDX39BQ13838 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDX39BQ13838 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDX39BQ13838 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
DDX39BQ13838 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDX39BQ13838 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDX39BQ13838 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDX39BQ13838 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDX39BQ13838 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDX39BQ13838 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DDX39BQ13838 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DDX39BQ13838 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DDX39BQ13838 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DDX39BQ13838 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DDX39BQ13838 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DDX39BQ13838 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DDX39BQ13838 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DDX39BQ13838 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DDX39BQ13838 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
DDX39BQ13838 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
DDX39BQ13838 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DDX39BQ13838 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DDX39BQ13838 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DDX39BQ13838 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DDX39BQ13838 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DDX39BQ13838 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DDX39BQ13838 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DDX39BQ13838 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
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