Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
PKD2Q13563 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
PKD2Q13563 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
PKD2Q13563 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
PKD2Q13563 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
PKD2Q13563 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
PKD2Q13563 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
PKD2Q13563 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PKD2Q13563 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
PKD2Q13563 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PKD2Q13563 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PKD2Q13563 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PKD2Q13563 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PKD2Q13563 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PKD2Q13563 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
PKD2Q13563 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
PKD2Q13563 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
PKD2Q13563 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PKD2Q13563 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
PKD2Q13563 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
PKD2Q13563 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
PKD2Q13563 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PKD2Q13563 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
PKD2Q13563 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PKD2Q13563 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PKD2Q13563 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PKD2Q13563 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
PKD2Q13563 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PKD2Q13563 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC31.09■■■□□ 2.57
PKD2Q13563 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PKD2Q13563 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PKD2Q13563 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC31.09■■■□□ 2.57
PKD2Q13563 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC31.09■■■□□ 2.57
PKD2Q13563 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
PKD2Q13563 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PKD2Q13563 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PKD2Q13563 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PKD2Q13563 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PKD2Q13563 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
PKD2Q13563 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PKD2Q13563 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PKD2Q13563 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
PKD2Q13563 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PKD2Q13563 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
PKD2Q13563 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PKD2Q13563 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
PKD2Q13563 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
PKD2Q13563 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
PKD2Q13563 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC31.08■■■□□ 2.57
PKD2Q13563 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
PKD2Q13563 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
PKD2Q13563 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
PKD2Q13563 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PKD2Q13563 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
PKD2Q13563 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
PKD2Q13563 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
PKD2Q13563 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
PKD2Q13563 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
PKD2Q13563 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
PKD2Q13563 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
PKD2Q13563 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
PKD2Q13563 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
PKD2Q13563 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
PKD2Q13563 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
PKD2Q13563 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
PKD2Q13563 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
PKD2Q13563 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
PKD2Q13563 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
PKD2Q13563 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
PKD2Q13563 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
PKD2Q13563 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
PKD2Q13563 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
PKD2Q13563 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PKD2Q13563 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
PKD2Q13563 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PKD2Q13563 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
PKD2Q13563 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC31.05■■■□□ 2.56
PKD2Q13563 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
PKD2Q13563 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
PKD2Q13563 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PKD2Q13563 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
PKD2Q13563 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
PKD2Q13563 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
PKD2Q13563 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
PKD2Q13563 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
PKD2Q13563 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
PKD2Q13563 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
PKD2Q13563 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
PKD2Q13563 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
PKD2Q13563 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
PKD2Q13563 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
PKD2Q13563 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
PKD2Q13563 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
PKD2Q13563 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
PKD2Q13563 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
PKD2Q13563 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
PKD2Q13563 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC31.04■■■□□ 2.56
PKD2Q13563 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
PKD2Q13563 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.03■■■□□ 2.56
PKD2Q13563 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
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