Protein–RNA interactions for Protein: Q13541

EIF4EBP1, Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EBP1Q13541 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EIF4EBP1Q13541 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EIF4EBP1Q13541 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EIF4EBP1Q13541 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EIF4EBP1Q13541 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EIF4EBP1Q13541 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
EIF4EBP1Q13541 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EIF4EBP1Q13541 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EIF4EBP1Q13541 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
EIF4EBP1Q13541 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EIF4EBP1Q13541 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
EIF4EBP1Q13541 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
EIF4EBP1Q13541 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EIF4EBP1Q13541 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EIF4EBP1Q13541 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EIF4EBP1Q13541 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EIF4EBP1Q13541 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EIF4EBP1Q13541 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EIF4EBP1Q13541 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EIF4EBP1Q13541 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
EIF4EBP1Q13541 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EIF4EBP1Q13541 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EIF4EBP1Q13541 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
EIF4EBP1Q13541 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
EIF4EBP1Q13541 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EIF4EBP1Q13541 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EIF4EBP1Q13541 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EIF4EBP1Q13541 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EIF4EBP1Q13541 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EIF4EBP1Q13541 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EIF4EBP1Q13541 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EIF4EBP1Q13541 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EIF4EBP1Q13541 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EIF4EBP1Q13541 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EIF4EBP1Q13541 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EIF4EBP1Q13541 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC17■□□□□ 0.31
EIF4EBP1Q13541 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EIF4EBP1Q13541 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EIF4EBP1Q13541 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EIF4EBP1Q13541 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EIF4EBP1Q13541 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EIF4EBP1Q13541 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EIF4EBP1Q13541 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EIF4EBP1Q13541 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
EIF4EBP1Q13541 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
EIF4EBP1Q13541 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
EIF4EBP1Q13541 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EIF4EBP1Q13541 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
EIF4EBP1Q13541 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EIF4EBP1Q13541 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EIF4EBP1Q13541 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC17■□□□□ 0.31
EIF4EBP1Q13541 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EIF4EBP1Q13541 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EIF4EBP1Q13541 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EIF4EBP1Q13541 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EIF4EBP1Q13541 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EIF4EBP1Q13541 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EIF4EBP1Q13541 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EIF4EBP1Q13541 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EIF4EBP1Q13541 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EIF4EBP1Q13541 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EIF4EBP1Q13541 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EIF4EBP1Q13541 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EIF4EBP1Q13541 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EIF4EBP1Q13541 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EIF4EBP1Q13541 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EIF4EBP1Q13541 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EIF4EBP1Q13541 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
EIF4EBP1Q13541 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EIF4EBP1Q13541 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EIF4EBP1Q13541 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
EIF4EBP1Q13541 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EIF4EBP1Q13541 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EIF4EBP1Q13541 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EIF4EBP1Q13541 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EIF4EBP1Q13541 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
EIF4EBP1Q13541 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EIF4EBP1Q13541 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EIF4EBP1Q13541 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EIF4EBP1Q13541 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EIF4EBP1Q13541 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
EIF4EBP1Q13541 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EIF4EBP1Q13541 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EIF4EBP1Q13541 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EIF4EBP1Q13541 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EIF4EBP1Q13541 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EIF4EBP1Q13541 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EIF4EBP1Q13541 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EIF4EBP1Q13541 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EIF4EBP1Q13541 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EIF4EBP1Q13541 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EIF4EBP1Q13541 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EIF4EBP1Q13541 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EIF4EBP1Q13541 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EIF4EBP1Q13541 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EIF4EBP1Q13541 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EIF4EBP1Q13541 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EIF4EBP1Q13541 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EIF4EBP1Q13541 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
EIF4EBP1Q13541 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms