Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TWF1Q12792 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TWF1Q12792 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TWF1Q12792 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TWF1Q12792 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TWF1Q12792 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TWF1Q12792 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TWF1Q12792 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TWF1Q12792 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TWF1Q12792 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TWF1Q12792 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TWF1Q12792 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TWF1Q12792 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TWF1Q12792 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TWF1Q12792 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TWF1Q12792 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TWF1Q12792 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TWF1Q12792 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TWF1Q12792 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TWF1Q12792 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TWF1Q12792 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TWF1Q12792 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TWF1Q12792 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TWF1Q12792 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TWF1Q12792 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TWF1Q12792 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TWF1Q12792 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TWF1Q12792 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TWF1Q12792 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TWF1Q12792 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TWF1Q12792 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TWF1Q12792 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TWF1Q12792 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TWF1Q12792 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TWF1Q12792 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TWF1Q12792 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TWF1Q12792 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TWF1Q12792 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TWF1Q12792 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TWF1Q12792 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TWF1Q12792 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TWF1Q12792 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TWF1Q12792 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TWF1Q12792 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TWF1Q12792 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TWF1Q12792 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TWF1Q12792 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TWF1Q12792 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TWF1Q12792 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TWF1Q12792 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TWF1Q12792 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TWF1Q12792 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TWF1Q12792 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TWF1Q12792 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TWF1Q12792 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TWF1Q12792 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TWF1Q12792 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TWF1Q12792 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TWF1Q12792 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TWF1Q12792 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TWF1Q12792 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TWF1Q12792 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TWF1Q12792 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TWF1Q12792 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TWF1Q12792 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TWF1Q12792 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TWF1Q12792 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TWF1Q12792 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TWF1Q12792 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TWF1Q12792 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TWF1Q12792 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TWF1Q12792 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TWF1Q12792 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TWF1Q12792 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TWF1Q12792 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TWF1Q12792 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TWF1Q12792 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TWF1Q12792 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TWF1Q12792 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TWF1Q12792 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TWF1Q12792 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TWF1Q12792 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TWF1Q12792 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TWF1Q12792 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TWF1Q12792 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TWF1Q12792 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TWF1Q12792 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TWF1Q12792 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TWF1Q12792 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TWF1Q12792 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TWF1Q12792 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TWF1Q12792 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TWF1Q12792 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TWF1Q12792 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TWF1Q12792 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TWF1Q12792 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TWF1Q12792 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TWF1Q12792 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TWF1Q12792 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TWF1Q12792 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
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