Protein–RNA interactions for Protein: Q10472

GALNT1, Polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALNT1Q10472 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GALNT1Q10472 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GALNT1Q10472 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GALNT1Q10472 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GALNT1Q10472 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GALNT1Q10472 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GALNT1Q10472 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GALNT1Q10472 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GALNT1Q10472 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GALNT1Q10472 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GALNT1Q10472 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
GALNT1Q10472 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GALNT1Q10472 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GALNT1Q10472 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GALNT1Q10472 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GALNT1Q10472 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GALNT1Q10472 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GALNT1Q10472 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GALNT1Q10472 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GALNT1Q10472 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GALNT1Q10472 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GALNT1Q10472 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GALNT1Q10472 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GALNT1Q10472 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GALNT1Q10472 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GALNT1Q10472 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GALNT1Q10472 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GALNT1Q10472 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GALNT1Q10472 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GALNT1Q10472 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GALNT1Q10472 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GALNT1Q10472 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GALNT1Q10472 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GALNT1Q10472 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
GALNT1Q10472 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GALNT1Q10472 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GALNT1Q10472 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
GALNT1Q10472 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GALNT1Q10472 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GALNT1Q10472 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GALNT1Q10472 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GALNT1Q10472 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GALNT1Q10472 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GALNT1Q10472 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GALNT1Q10472 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GALNT1Q10472 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GALNT1Q10472 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GALNT1Q10472 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GALNT1Q10472 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GALNT1Q10472 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GALNT1Q10472 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GALNT1Q10472 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GALNT1Q10472 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GALNT1Q10472 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GALNT1Q10472 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GALNT1Q10472 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GALNT1Q10472 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GALNT1Q10472 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GALNT1Q10472 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GALNT1Q10472 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GALNT1Q10472 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GALNT1Q10472 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GALNT1Q10472 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GALNT1Q10472 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GALNT1Q10472 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GALNT1Q10472 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GALNT1Q10472 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GALNT1Q10472 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GALNT1Q10472 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GALNT1Q10472 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GALNT1Q10472 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GALNT1Q10472 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GALNT1Q10472 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GALNT1Q10472 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GALNT1Q10472 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GALNT1Q10472 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GALNT1Q10472 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GALNT1Q10472 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GALNT1Q10472 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GALNT1Q10472 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GALNT1Q10472 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GALNT1Q10472 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GALNT1Q10472 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GALNT1Q10472 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GALNT1Q10472 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GALNT1Q10472 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GALNT1Q10472 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GALNT1Q10472 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GALNT1Q10472 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GALNT1Q10472 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GALNT1Q10472 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GALNT1Q10472 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GALNT1Q10472 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GALNT1Q10472 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GALNT1Q10472 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GALNT1Q10472 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GALNT1Q10472 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GALNT1Q10472 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GALNT1Q10472 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GALNT1Q10472 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms