Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC173Q0VFZ6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC173Q0VFZ6 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC173Q0VFZ6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC173Q0VFZ6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC173Q0VFZ6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC173Q0VFZ6 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC173Q0VFZ6 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC173Q0VFZ6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC173Q0VFZ6 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC173Q0VFZ6 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC173Q0VFZ6 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC173Q0VFZ6 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC173Q0VFZ6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC173Q0VFZ6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC173Q0VFZ6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC173Q0VFZ6 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC173Q0VFZ6 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC173Q0VFZ6 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC173Q0VFZ6 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC173Q0VFZ6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC173Q0VFZ6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC173Q0VFZ6 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC173Q0VFZ6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC173Q0VFZ6 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC173Q0VFZ6 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC173Q0VFZ6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC173Q0VFZ6 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC173Q0VFZ6 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC173Q0VFZ6 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC173Q0VFZ6 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC173Q0VFZ6 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC173Q0VFZ6 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC173Q0VFZ6 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC173Q0VFZ6 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC173Q0VFZ6 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC173Q0VFZ6 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC173Q0VFZ6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC173Q0VFZ6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC173Q0VFZ6 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC173Q0VFZ6 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC173Q0VFZ6 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC173Q0VFZ6 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC173Q0VFZ6 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC173Q0VFZ6 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC173Q0VFZ6 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC173Q0VFZ6 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC173Q0VFZ6 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC173Q0VFZ6 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC173Q0VFZ6 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC173Q0VFZ6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC173Q0VFZ6 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC173Q0VFZ6 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC173Q0VFZ6 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC173Q0VFZ6 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC173Q0VFZ6 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC173Q0VFZ6 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC173Q0VFZ6 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC173Q0VFZ6 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC173Q0VFZ6 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC173Q0VFZ6 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC173Q0VFZ6 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC173Q0VFZ6 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC173Q0VFZ6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC173Q0VFZ6 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC173Q0VFZ6 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC173Q0VFZ6 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC173Q0VFZ6 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC173Q0VFZ6 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC173Q0VFZ6 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC173Q0VFZ6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC173Q0VFZ6 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC173Q0VFZ6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC173Q0VFZ6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC173Q0VFZ6 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC173Q0VFZ6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC173Q0VFZ6 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC173Q0VFZ6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC173Q0VFZ6 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC173Q0VFZ6 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC173Q0VFZ6 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC173Q0VFZ6 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC173Q0VFZ6 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC173Q0VFZ6 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC173Q0VFZ6 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC173Q0VFZ6 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC173Q0VFZ6 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC173Q0VFZ6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC173Q0VFZ6 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC173Q0VFZ6 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC173Q0VFZ6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC173Q0VFZ6 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC173Q0VFZ6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC173Q0VFZ6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC173Q0VFZ6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC173Q0VFZ6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC173Q0VFZ6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC173Q0VFZ6 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC173Q0VFZ6 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC173Q0VFZ6 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms