Protein–RNA interactions for Protein: Q04118

PRB3, Basic salivary proline-rich protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB3Q04118 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRB3Q04118 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PRB3Q04118 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PRB3Q04118 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PRB3Q04118 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRB3Q04118 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRB3Q04118 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRB3Q04118 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRB3Q04118 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRB3Q04118 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRB3Q04118 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRB3Q04118 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms