Protein–RNA interactions for Protein: Q02535

ID3, DNA-binding protein inhibitor ID-3, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ID3Q02535 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ID3Q02535 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ID3Q02535 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ID3Q02535 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ID3Q02535 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ID3Q02535 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ID3Q02535 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ID3Q02535 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ID3Q02535 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ID3Q02535 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ID3Q02535 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ID3Q02535 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ID3Q02535 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ID3Q02535 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ID3Q02535 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ID3Q02535 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ID3Q02535 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ID3Q02535 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ID3Q02535 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ID3Q02535 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ID3Q02535 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ID3Q02535 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ID3Q02535 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ID3Q02535 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ID3Q02535 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ID3Q02535 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ID3Q02535 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ID3Q02535 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ID3Q02535 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ID3Q02535 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ID3Q02535 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ID3Q02535 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ID3Q02535 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ID3Q02535 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ID3Q02535 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ID3Q02535 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ID3Q02535 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ID3Q02535 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ID3Q02535 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ID3Q02535 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ID3Q02535 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ID3Q02535 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ID3Q02535 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ID3Q02535 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ID3Q02535 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ID3Q02535 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ID3Q02535 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ID3Q02535 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ID3Q02535 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ID3Q02535 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ID3Q02535 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ID3Q02535 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ID3Q02535 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ID3Q02535 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ID3Q02535 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ID3Q02535 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ID3Q02535 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ID3Q02535 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ID3Q02535 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ID3Q02535 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ID3Q02535 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ID3Q02535 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ID3Q02535 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ID3Q02535 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ID3Q02535 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ID3Q02535 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ID3Q02535 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ID3Q02535 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ID3Q02535 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ID3Q02535 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ID3Q02535 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ID3Q02535 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ID3Q02535 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ID3Q02535 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ID3Q02535 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ID3Q02535 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ID3Q02535 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ID3Q02535 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ID3Q02535 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ID3Q02535 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ID3Q02535 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ID3Q02535 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ID3Q02535 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ID3Q02535 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ID3Q02535 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ID3Q02535 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ID3Q02535 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ID3Q02535 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ID3Q02535 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ID3Q02535 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ID3Q02535 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ID3Q02535 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ID3Q02535 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ID3Q02535 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ID3Q02535 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ID3Q02535 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ID3Q02535 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ID3Q02535 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ID3Q02535 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ID3Q02535 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms