Protein–RNA interactions for Protein: Q02410

APBA1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA1Q02410 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APBA1Q02410 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
APBA1Q02410 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APBA1Q02410 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APBA1Q02410 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APBA1Q02410 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APBA1Q02410 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APBA1Q02410 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APBA1Q02410 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APBA1Q02410 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APBA1Q02410 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APBA1Q02410 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APBA1Q02410 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APBA1Q02410 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APBA1Q02410 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APBA1Q02410 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APBA1Q02410 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APBA1Q02410 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APBA1Q02410 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
APBA1Q02410 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APBA1Q02410 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APBA1Q02410 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APBA1Q02410 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APBA1Q02410 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APBA1Q02410 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APBA1Q02410 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APBA1Q02410 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APBA1Q02410 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APBA1Q02410 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APBA1Q02410 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APBA1Q02410 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APBA1Q02410 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APBA1Q02410 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APBA1Q02410 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APBA1Q02410 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APBA1Q02410 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APBA1Q02410 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APBA1Q02410 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APBA1Q02410 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APBA1Q02410 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
APBA1Q02410 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APBA1Q02410 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
APBA1Q02410 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
APBA1Q02410 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APBA1Q02410 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APBA1Q02410 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APBA1Q02410 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APBA1Q02410 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APBA1Q02410 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APBA1Q02410 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APBA1Q02410 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APBA1Q02410 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
APBA1Q02410 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
APBA1Q02410 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APBA1Q02410 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
APBA1Q02410 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APBA1Q02410 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
APBA1Q02410 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APBA1Q02410 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
APBA1Q02410 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APBA1Q02410 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
APBA1Q02410 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APBA1Q02410 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APBA1Q02410 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APBA1Q02410 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APBA1Q02410 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APBA1Q02410 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APBA1Q02410 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APBA1Q02410 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APBA1Q02410 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APBA1Q02410 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APBA1Q02410 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APBA1Q02410 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APBA1Q02410 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APBA1Q02410 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APBA1Q02410 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APBA1Q02410 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APBA1Q02410 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APBA1Q02410 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APBA1Q02410 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APBA1Q02410 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APBA1Q02410 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APBA1Q02410 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APBA1Q02410 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APBA1Q02410 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APBA1Q02410 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APBA1Q02410 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APBA1Q02410 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APBA1Q02410 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
APBA1Q02410 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APBA1Q02410 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APBA1Q02410 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APBA1Q02410 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APBA1Q02410 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APBA1Q02410 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APBA1Q02410 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APBA1Q02410 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APBA1Q02410 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
APBA1Q02410 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
APBA1Q02410 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms