Protein–RNA interactions for Protein: P80303

NUCB2, Nucleobindin-2, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB2P80303 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUCB2P80303 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUCB2P80303 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUCB2P80303 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUCB2P80303 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUCB2P80303 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUCB2P80303 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUCB2P80303 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NUCB2P80303 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUCB2P80303 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUCB2P80303 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUCB2P80303 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUCB2P80303 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUCB2P80303 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUCB2P80303 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUCB2P80303 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUCB2P80303 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NUCB2P80303 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUCB2P80303 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUCB2P80303 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUCB2P80303 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUCB2P80303 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUCB2P80303 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUCB2P80303 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUCB2P80303 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUCB2P80303 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUCB2P80303 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUCB2P80303 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUCB2P80303 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUCB2P80303 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUCB2P80303 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUCB2P80303 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUCB2P80303 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUCB2P80303 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUCB2P80303 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUCB2P80303 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUCB2P80303 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUCB2P80303 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUCB2P80303 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUCB2P80303 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUCB2P80303 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUCB2P80303 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NUCB2P80303 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUCB2P80303 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUCB2P80303 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUCB2P80303 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUCB2P80303 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUCB2P80303 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUCB2P80303 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NUCB2P80303 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUCB2P80303 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUCB2P80303 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUCB2P80303 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUCB2P80303 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUCB2P80303 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NUCB2P80303 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUCB2P80303 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUCB2P80303 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUCB2P80303 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUCB2P80303 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NUCB2P80303 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUCB2P80303 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUCB2P80303 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUCB2P80303 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUCB2P80303 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUCB2P80303 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUCB2P80303 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUCB2P80303 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUCB2P80303 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUCB2P80303 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUCB2P80303 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUCB2P80303 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUCB2P80303 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUCB2P80303 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUCB2P80303 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUCB2P80303 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUCB2P80303 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUCB2P80303 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUCB2P80303 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUCB2P80303 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUCB2P80303 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUCB2P80303 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUCB2P80303 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUCB2P80303 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUCB2P80303 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUCB2P80303 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NUCB2P80303 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUCB2P80303 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUCB2P80303 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUCB2P80303 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUCB2P80303 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUCB2P80303 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUCB2P80303 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUCB2P80303 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUCB2P80303 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUCB2P80303 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NUCB2P80303 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NUCB2P80303 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NUCB2P80303 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NUCB2P80303 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms