Protein–RNA interactions for Protein: P78411

IRX5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 483 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX5P78411 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IRX5P78411 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IRX5P78411 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IRX5P78411 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IRX5P78411 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRX5P78411 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
IRX5P78411 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRX5P78411 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRX5P78411 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRX5P78411 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRX5P78411 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRX5P78411 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
IRX5P78411 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRX5P78411 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRX5P78411 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRX5P78411 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRX5P78411 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRX5P78411 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IRX5P78411 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
IRX5P78411 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
IRX5P78411 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
IRX5P78411 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
IRX5P78411 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
IRX5P78411 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
IRX5P78411 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
IRX5P78411 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IRX5P78411 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
IRX5P78411 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IRX5P78411 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
IRX5P78411 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
IRX5P78411 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IRX5P78411 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IRX5P78411 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IRX5P78411 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IRX5P78411 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IRX5P78411 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IRX5P78411 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IRX5P78411 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
IRX5P78411 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IRX5P78411 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IRX5P78411 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IRX5P78411 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
IRX5P78411 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IRX5P78411 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
IRX5P78411 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IRX5P78411 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IRX5P78411 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IRX5P78411 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IRX5P78411 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IRX5P78411 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IRX5P78411 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IRX5P78411 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IRX5P78411 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IRX5P78411 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IRX5P78411 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IRX5P78411 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IRX5P78411 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IRX5P78411 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
IRX5P78411 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IRX5P78411 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IRX5P78411 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IRX5P78411 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IRX5P78411 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IRX5P78411 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IRX5P78411 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IRX5P78411 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IRX5P78411 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IRX5P78411 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IRX5P78411 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IRX5P78411 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IRX5P78411 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IRX5P78411 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
IRX5P78411 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
IRX5P78411 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IRX5P78411 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IRX5P78411 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IRX5P78411 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
IRX5P78411 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IRX5P78411 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
IRX5P78411 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
IRX5P78411 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IRX5P78411 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IRX5P78411 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IRX5P78411 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IRX5P78411 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IRX5P78411 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IRX5P78411 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IRX5P78411 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
IRX5P78411 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IRX5P78411 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IRX5P78411 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IRX5P78411 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IRX5P78411 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IRX5P78411 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IRX5P78411 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IRX5P78411 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IRX5P78411 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IRX5P78411 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
IRX5P78411 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
IRX5P78411 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms