Protein–RNA interactions for Protein: P55008

AIF1, Allograft inflammatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AIF1P55008 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
AIF1P55008 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AIF1P55008 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AIF1P55008 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
AIF1P55008 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AIF1P55008 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AIF1P55008 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
AIF1P55008 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AIF1P55008 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AIF1P55008 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
AIF1P55008 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AIF1P55008 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AIF1P55008 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AIF1P55008 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AIF1P55008 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AIF1P55008 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
AIF1P55008 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
AIF1P55008 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
AIF1P55008 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
AIF1P55008 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AIF1P55008 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AIF1P55008 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AIF1P55008 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
AIF1P55008 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
AIF1P55008 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
AIF1P55008 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
AIF1P55008 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AIF1P55008 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AIF1P55008 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
AIF1P55008 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
AIF1P55008 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AIF1P55008 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
AIF1P55008 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AIF1P55008 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AIF1P55008 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
AIF1P55008 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
AIF1P55008 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AIF1P55008 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
AIF1P55008 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
AIF1P55008 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
AIF1P55008 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
AIF1P55008 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
AIF1P55008 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
AIF1P55008 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
AIF1P55008 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
AIF1P55008 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
AIF1P55008 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
AIF1P55008 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
AIF1P55008 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
AIF1P55008 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
AIF1P55008 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AIF1P55008 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AIF1P55008 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AIF1P55008 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
AIF1P55008 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
AIF1P55008 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AIF1P55008 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AIF1P55008 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
AIF1P55008 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
AIF1P55008 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
AIF1P55008 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AIF1P55008 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
AIF1P55008 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
AIF1P55008 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
AIF1P55008 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
AIF1P55008 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
AIF1P55008 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
AIF1P55008 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
AIF1P55008 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
AIF1P55008 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AIF1P55008 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
AIF1P55008 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AIF1P55008 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AIF1P55008 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AIF1P55008 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AIF1P55008 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AIF1P55008 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AIF1P55008 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
AIF1P55008 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
AIF1P55008 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AIF1P55008 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AIF1P55008 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
AIF1P55008 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
AIF1P55008 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
AIF1P55008 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
AIF1P55008 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
AIF1P55008 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AIF1P55008 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AIF1P55008 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
AIF1P55008 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AIF1P55008 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AIF1P55008 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AIF1P55008 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AIF1P55008 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AIF1P55008 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AIF1P55008 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AIF1P55008 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AIF1P55008 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AIF1P55008 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AIF1P55008 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms