Protein–RNA interactions for Protein: P53708

ITGA8, Integrin alpha-8, humanhuman

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA8P53708 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGA8P53708 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGA8P53708 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGA8P53708 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGA8P53708 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGA8P53708 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGA8P53708 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGA8P53708 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGA8P53708 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGA8P53708 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGA8P53708 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGA8P53708 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGA8P53708 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGA8P53708 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGA8P53708 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGA8P53708 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGA8P53708 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGA8P53708 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGA8P53708 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGA8P53708 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA8P53708 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA8P53708 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA8P53708 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA8P53708 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA8P53708 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA8P53708 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA8P53708 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA8P53708 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA8P53708 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA8P53708 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA8P53708 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA8P53708 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA8P53708 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA8P53708 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA8P53708 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA8P53708 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA8P53708 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA8P53708 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA8P53708 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA8P53708 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA8P53708 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA8P53708 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA8P53708 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA8P53708 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA8P53708 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA8P53708 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA8P53708 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA8P53708 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA8P53708 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA8P53708 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA8P53708 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA8P53708 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA8P53708 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA8P53708 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA8P53708 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA8P53708 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA8P53708 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA8P53708 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA8P53708 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA8P53708 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA8P53708 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA8P53708 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA8P53708 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA8P53708 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA8P53708 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA8P53708 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA8P53708 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA8P53708 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ITGA8P53708 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGA8P53708 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGA8P53708 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGA8P53708 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGA8P53708 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGA8P53708 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGA8P53708 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGA8P53708 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGA8P53708 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGA8P53708 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGA8P53708 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGA8P53708 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGA8P53708 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGA8P53708 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA8P53708 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA8P53708 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA8P53708 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA8P53708 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA8P53708 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA8P53708 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA8P53708 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA8P53708 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA8P53708 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA8P53708 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA8P53708 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA8P53708 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA8P53708 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA8P53708 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA8P53708 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA8P53708 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA8P53708 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA8P53708 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms