Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXD12P35452 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXD12P35452 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXD12P35452 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXD12P35452 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXD12P35452 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXD12P35452 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXD12P35452 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXD12P35452 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXD12P35452 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXD12P35452 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXD12P35452 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXD12P35452 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXD12P35452 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXD12P35452 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXD12P35452 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXD12P35452 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXD12P35452 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXD12P35452 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXD12P35452 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXD12P35452 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HOXD12P35452 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXD12P35452 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXD12P35452 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXD12P35452 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXD12P35452 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXD12P35452 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXD12P35452 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXD12P35452 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXD12P35452 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
HOXD12P35452 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXD12P35452 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXD12P35452 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXD12P35452 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXD12P35452 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXD12P35452 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXD12P35452 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXD12P35452 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXD12P35452 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXD12P35452 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXD12P35452 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXD12P35452 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXD12P35452 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXD12P35452 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HOXD12P35452 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
HOXD12P35452 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
HOXD12P35452 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
HOXD12P35452 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
HOXD12P35452 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
HOXD12P35452 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXD12P35452 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXD12P35452 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXD12P35452 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXD12P35452 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXD12P35452 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXD12P35452 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXD12P35452 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXD12P35452 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXD12P35452 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXD12P35452 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXD12P35452 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD12P35452 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD12P35452 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD12P35452 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD12P35452 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD12P35452 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD12P35452 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD12P35452 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD12P35452 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD12P35452 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD12P35452 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD12P35452 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD12P35452 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD12P35452 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD12P35452 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD12P35452 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD12P35452 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD12P35452 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD12P35452 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD12P35452 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXD12P35452 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXD12P35452 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXD12P35452 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXD12P35452 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXD12P35452 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXD12P35452 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXD12P35452 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXD12P35452 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXD12P35452 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXD12P35452 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXD12P35452 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXD12P35452 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXD12P35452 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXD12P35452 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXD12P35452 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXD12P35452 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXD12P35452 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXD12P35452 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXD12P35452 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXD12P35452 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms