Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
OTX2P32243 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
OTX2P32243 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
OTX2P32243 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
OTX2P32243 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
OTX2P32243 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
OTX2P32243 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
OTX2P32243 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
OTX2P32243 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
OTX2P32243 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
OTX2P32243 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
OTX2P32243 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
OTX2P32243 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
OTX2P32243 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
OTX2P32243 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
OTX2P32243 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
OTX2P32243 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
OTX2P32243 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
OTX2P32243 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
OTX2P32243 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
OTX2P32243 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
OTX2P32243 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
OTX2P32243 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
OTX2P32243 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
OTX2P32243 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
OTX2P32243 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
OTX2P32243 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
OTX2P32243 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
OTX2P32243 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
OTX2P32243 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
OTX2P32243 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
OTX2P32243 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
OTX2P32243 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
OTX2P32243 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
OTX2P32243 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
OTX2P32243 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
OTX2P32243 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
OTX2P32243 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
OTX2P32243 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
OTX2P32243 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
OTX2P32243 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
OTX2P32243 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
OTX2P32243 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
OTX2P32243 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
OTX2P32243 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
OTX2P32243 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
OTX2P32243 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
OTX2P32243 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
OTX2P32243 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
OTX2P32243 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
OTX2P32243 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
OTX2P32243 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
OTX2P32243 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
OTX2P32243 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
OTX2P32243 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
OTX2P32243 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
OTX2P32243 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
OTX2P32243 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
OTX2P32243 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
OTX2P32243 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
OTX2P32243 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
OTX2P32243 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
OTX2P32243 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
OTX2P32243 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
OTX2P32243 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
OTX2P32243 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
OTX2P32243 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
OTX2P32243 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
OTX2P32243 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
OTX2P32243 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
OTX2P32243 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
OTX2P32243 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
OTX2P32243 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
OTX2P32243 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
OTX2P32243 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
OTX2P32243 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
OTX2P32243 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
OTX2P32243 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
OTX2P32243 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
OTX2P32243 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
OTX2P32243 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
OTX2P32243 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
OTX2P32243 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
OTX2P32243 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
OTX2P32243 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
OTX2P32243 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
OTX2P32243 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
OTX2P32243 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
OTX2P32243 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
OTX2P32243 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
OTX2P32243 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
OTX2P32243 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
OTX2P32243 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
OTX2P32243 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
OTX2P32243 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
OTX2P32243 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
OTX2P32243 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
OTX2P32243 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
OTX2P32243 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
OTX2P32243 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms