Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASQ1P31415 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASQ1P31415 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASQ1P31415 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASQ1P31415 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASQ1P31415 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASQ1P31415 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASQ1P31415 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASQ1P31415 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASQ1P31415 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASQ1P31415 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASQ1P31415 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASQ1P31415 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASQ1P31415 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CASQ1P31415 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASQ1P31415 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASQ1P31415 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASQ1P31415 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASQ1P31415 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASQ1P31415 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASQ1P31415 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASQ1P31415 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CASQ1P31415 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASQ1P31415 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASQ1P31415 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASQ1P31415 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASQ1P31415 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASQ1P31415 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASQ1P31415 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASQ1P31415 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CASQ1P31415 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASQ1P31415 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASQ1P31415 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASQ1P31415 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASQ1P31415 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASQ1P31415 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASQ1P31415 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASQ1P31415 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASQ1P31415 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASQ1P31415 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASQ1P31415 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASQ1P31415 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASQ1P31415 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASQ1P31415 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASQ1P31415 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASQ1P31415 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASQ1P31415 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASQ1P31415 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASQ1P31415 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASQ1P31415 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASQ1P31415 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASQ1P31415 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASQ1P31415 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASQ1P31415 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASQ1P31415 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASQ1P31415 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASQ1P31415 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASQ1P31415 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASQ1P31415 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASQ1P31415 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASQ1P31415 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASQ1P31415 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASQ1P31415 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASQ1P31415 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASQ1P31415 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASQ1P31415 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASQ1P31415 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASQ1P31415 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASQ1P31415 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASQ1P31415 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASQ1P31415 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASQ1P31415 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASQ1P31415 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASQ1P31415 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASQ1P31415 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CASQ1P31415 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASQ1P31415 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASQ1P31415 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASQ1P31415 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASQ1P31415 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASQ1P31415 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASQ1P31415 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASQ1P31415 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CASQ1P31415 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CASQ1P31415 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CASQ1P31415 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASQ1P31415 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASQ1P31415 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASQ1P31415 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASQ1P31415 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASQ1P31415 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASQ1P31415 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASQ1P31415 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CASQ1P31415 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASQ1P31415 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CASQ1P31415 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASQ1P31415 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASQ1P31415 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASQ1P31415 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASQ1P31415 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms