Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TSPOP30536 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TSPOP30536 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TSPOP30536 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TSPOP30536 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TSPOP30536 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TSPOP30536 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TSPOP30536 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TSPOP30536 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TSPOP30536 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TSPOP30536 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TSPOP30536 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSPOP30536 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSPOP30536 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSPOP30536 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSPOP30536 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSPOP30536 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSPOP30536 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSPOP30536 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSPOP30536 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSPOP30536 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSPOP30536 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSPOP30536 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSPOP30536 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSPOP30536 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSPOP30536 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSPOP30536 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TSPOP30536 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSPOP30536 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TSPOP30536 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSPOP30536 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSPOP30536 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSPOP30536 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSPOP30536 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSPOP30536 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSPOP30536 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSPOP30536 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSPOP30536 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSPOP30536 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSPOP30536 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSPOP30536 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSPOP30536 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSPOP30536 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSPOP30536 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSPOP30536 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSPOP30536 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSPOP30536 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSPOP30536 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSPOP30536 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSPOP30536 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSPOP30536 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSPOP30536 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSPOP30536 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TSPOP30536 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSPOP30536 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSPOP30536 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSPOP30536 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSPOP30536 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSPOP30536 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSPOP30536 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSPOP30536 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSPOP30536 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSPOP30536 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSPOP30536 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSPOP30536 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSPOP30536 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSPOP30536 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSPOP30536 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSPOP30536 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSPOP30536 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSPOP30536 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSPOP30536 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSPOP30536 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSPOP30536 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSPOP30536 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSPOP30536 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSPOP30536 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSPOP30536 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSPOP30536 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TSPOP30536 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSPOP30536 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSPOP30536 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSPOP30536 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSPOP30536 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TSPOP30536 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSPOP30536 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSPOP30536 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TSPOP30536 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSPOP30536 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TSPOP30536 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSPOP30536 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSPOP30536 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSPOP30536 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSPOP30536 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSPOP30536 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSPOP30536 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSPOP30536 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSPOP30536 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSPOP30536 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TSPOP30536 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms