Protein–RNA interactions for Protein: P23497

SP100, Nuclear autoantigen Sp-100, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP100P23497 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SP100P23497 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SP100P23497 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SP100P23497 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SP100P23497 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SP100P23497 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SP100P23497 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SP100P23497 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SP100P23497 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SP100P23497 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SP100P23497 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SP100P23497 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SP100P23497 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SP100P23497 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SP100P23497 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SP100P23497 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SP100P23497 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SP100P23497 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SP100P23497 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SP100P23497 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SP100P23497 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SP100P23497 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SP100P23497 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SP100P23497 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SP100P23497 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SP100P23497 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SP100P23497 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SP100P23497 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SP100P23497 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SP100P23497 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SP100P23497 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SP100P23497 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SP100P23497 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SP100P23497 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SP100P23497 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SP100P23497 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SP100P23497 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SP100P23497 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SP100P23497 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SP100P23497 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SP100P23497 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SP100P23497 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SP100P23497 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SP100P23497 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SP100P23497 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SP100P23497 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SP100P23497 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SP100P23497 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SP100P23497 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SP100P23497 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SP100P23497 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SP100P23497 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SP100P23497 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SP100P23497 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SP100P23497 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SP100P23497 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SP100P23497 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SP100P23497 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SP100P23497 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SP100P23497 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SP100P23497 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SP100P23497 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SP100P23497 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SP100P23497 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SP100P23497 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SP100P23497 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SP100P23497 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SP100P23497 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SP100P23497 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SP100P23497 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SP100P23497 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SP100P23497 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SP100P23497 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SP100P23497 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SP100P23497 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SP100P23497 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SP100P23497 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SP100P23497 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SP100P23497 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SP100P23497 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SP100P23497 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SP100P23497 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SP100P23497 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SP100P23497 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SP100P23497 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SP100P23497 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SP100P23497 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SP100P23497 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SP100P23497 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SP100P23497 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SP100P23497 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SP100P23497 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SP100P23497 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SP100P23497 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SP100P23497 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SP100P23497 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SP100P23497 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SP100P23497 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SP100P23497 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SP100P23497 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms