Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK11BP21127 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK11BP21127 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK11BP21127 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK11BP21127 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK11BP21127 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK11BP21127 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDK11BP21127 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDK11BP21127 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDK11BP21127 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDK11BP21127 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDK11BP21127 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CDK11BP21127 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK11BP21127 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK11BP21127 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK11BP21127 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK11BP21127 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK11BP21127 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK11BP21127 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK11BP21127 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK11BP21127 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK11BP21127 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK11BP21127 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK11BP21127 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK11BP21127 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK11BP21127 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK11BP21127 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK11BP21127 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK11BP21127 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK11BP21127 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK11BP21127 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK11BP21127 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK11BP21127 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK11BP21127 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK11BP21127 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK11BP21127 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK11BP21127 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK11BP21127 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK11BP21127 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK11BP21127 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK11BP21127 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK11BP21127 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK11BP21127 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK11BP21127 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK11BP21127 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDK11BP21127 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDK11BP21127 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDK11BP21127 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDK11BP21127 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDK11BP21127 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDK11BP21127 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDK11BP21127 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDK11BP21127 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDK11BP21127 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDK11BP21127 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDK11BP21127 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDK11BP21127 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDK11BP21127 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDK11BP21127 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDK11BP21127 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDK11BP21127 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDK11BP21127 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDK11BP21127 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDK11BP21127 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDK11BP21127 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CDK11BP21127 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDK11BP21127 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDK11BP21127 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDK11BP21127 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDK11BP21127 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDK11BP21127 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDK11BP21127 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDK11BP21127 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDK11BP21127 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CDK11BP21127 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDK11BP21127 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDK11BP21127 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDK11BP21127 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDK11BP21127 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK11BP21127 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK11BP21127 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK11BP21127 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK11BP21127 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK11BP21127 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK11BP21127 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK11BP21127 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK11BP21127 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK11BP21127 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK11BP21127 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK11BP21127 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK11BP21127 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK11BP21127 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK11BP21127 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK11BP21127 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK11BP21127 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK11BP21127 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK11BP21127 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK11BP21127 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK11BP21127 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK11BP21127 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms