Protein–RNA interactions for Protein: P20851

C4BPB, C4b-binding protein beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BPBP20851 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C4BPBP20851 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C4BPBP20851 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C4BPBP20851 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C4BPBP20851 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C4BPBP20851 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C4BPBP20851 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C4BPBP20851 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C4BPBP20851 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C4BPBP20851 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C4BPBP20851 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C4BPBP20851 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C4BPBP20851 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C4BPBP20851 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C4BPBP20851 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C4BPBP20851 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C4BPBP20851 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C4BPBP20851 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C4BPBP20851 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C4BPBP20851 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C4BPBP20851 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C4BPBP20851 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C4BPBP20851 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C4BPBP20851 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C4BPBP20851 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C4BPBP20851 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C4BPBP20851 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C4BPBP20851 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C4BPBP20851 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C4BPBP20851 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C4BPBP20851 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C4BPBP20851 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C4BPBP20851 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C4BPBP20851 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C4BPBP20851 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C4BPBP20851 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C4BPBP20851 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C4BPBP20851 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C4BPBP20851 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C4BPBP20851 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C4BPBP20851 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C4BPBP20851 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C4BPBP20851 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C4BPBP20851 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C4BPBP20851 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C4BPBP20851 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C4BPBP20851 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C4BPBP20851 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C4BPBP20851 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C4BPBP20851 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C4BPBP20851 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C4BPBP20851 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C4BPBP20851 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C4BPBP20851 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C4BPBP20851 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C4BPBP20851 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
C4BPBP20851 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C4BPBP20851 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C4BPBP20851 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C4BPBP20851 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C4BPBP20851 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C4BPBP20851 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C4BPBP20851 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C4BPBP20851 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C4BPBP20851 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C4BPBP20851 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C4BPBP20851 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C4BPBP20851 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C4BPBP20851 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C4BPBP20851 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C4BPBP20851 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C4BPBP20851 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C4BPBP20851 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C4BPBP20851 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C4BPBP20851 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C4BPBP20851 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C4BPBP20851 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C4BPBP20851 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C4BPBP20851 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C4BPBP20851 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C4BPBP20851 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C4BPBP20851 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C4BPBP20851 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C4BPBP20851 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C4BPBP20851 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C4BPBP20851 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C4BPBP20851 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C4BPBP20851 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C4BPBP20851 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C4BPBP20851 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C4BPBP20851 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C4BPBP20851 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C4BPBP20851 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C4BPBP20851 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
C4BPBP20851 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C4BPBP20851 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C4BPBP20851 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C4BPBP20851 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C4BPBP20851 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C4BPBP20851 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.5 ms