Protein–RNA interactions for Protein: P17213

BPI, Bactericidal permeability-increasing protein, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIP17213 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BPIP17213 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BPIP17213 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BPIP17213 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
BPIP17213 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BPIP17213 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BPIP17213 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BPIP17213 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BPIP17213 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BPIP17213 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BPIP17213 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BPIP17213 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BPIP17213 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BPIP17213 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BPIP17213 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BPIP17213 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BPIP17213 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BPIP17213 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BPIP17213 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BPIP17213 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BPIP17213 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BPIP17213 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
BPIP17213 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BPIP17213 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BPIP17213 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BPIP17213 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BPIP17213 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BPIP17213 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BPIP17213 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BPIP17213 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BPIP17213 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BPIP17213 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BPIP17213 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BPIP17213 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BPIP17213 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BPIP17213 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BPIP17213 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BPIP17213 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BPIP17213 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BPIP17213 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BPIP17213 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BPIP17213 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BPIP17213 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BPIP17213 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BPIP17213 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BPIP17213 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BPIP17213 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BPIP17213 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BPIP17213 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BPIP17213 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
BPIP17213 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BPIP17213 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BPIP17213 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BPIP17213 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BPIP17213 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
BPIP17213 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BPIP17213 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BPIP17213 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
BPIP17213 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BPIP17213 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BPIP17213 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BPIP17213 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BPIP17213 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BPIP17213 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BPIP17213 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BPIP17213 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BPIP17213 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BPIP17213 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BPIP17213 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
BPIP17213 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BPIP17213 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BPIP17213 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BPIP17213 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BPIP17213 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BPIP17213 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BPIP17213 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BPIP17213 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BPIP17213 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BPIP17213 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BPIP17213 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BPIP17213 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BPIP17213 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BPIP17213 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BPIP17213 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
BPIP17213 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BPIP17213 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BPIP17213 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BPIP17213 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BPIP17213 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BPIP17213 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BPIP17213 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BPIP17213 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BPIP17213 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BPIP17213 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BPIP17213 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BPIP17213 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BPIP17213 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BPIP17213 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
BPIP17213 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
BPIP17213 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms