Protein–RNA interactions for Protein: P13984

GTF2F2, General transcription factor IIF subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F2P13984 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2F2P13984 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2F2P13984 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2F2P13984 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2F2P13984 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2F2P13984 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2F2P13984 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2F2P13984 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
GTF2F2P13984 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GTF2F2P13984 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GTF2F2P13984 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GTF2F2P13984 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2F2P13984 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2F2P13984 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2F2P13984 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2F2P13984 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2F2P13984 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2F2P13984 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2F2P13984 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2F2P13984 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2F2P13984 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2F2P13984 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2F2P13984 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2F2P13984 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2F2P13984 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2F2P13984 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2F2P13984 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2F2P13984 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2F2P13984 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2F2P13984 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2F2P13984 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2F2P13984 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2F2P13984 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2F2P13984 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2F2P13984 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2F2P13984 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2F2P13984 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2F2P13984 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2F2P13984 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2F2P13984 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2F2P13984 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2F2P13984 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2F2P13984 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2F2P13984 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2F2P13984 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2F2P13984 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2F2P13984 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2F2P13984 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2F2P13984 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2F2P13984 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2F2P13984 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2F2P13984 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2F2P13984 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2F2P13984 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2F2P13984 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2F2P13984 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2F2P13984 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2F2P13984 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2F2P13984 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2F2P13984 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2F2P13984 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2F2P13984 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2F2P13984 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2F2P13984 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2F2P13984 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2F2P13984 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2F2P13984 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2F2P13984 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2F2P13984 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2F2P13984 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2F2P13984 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2F2P13984 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2F2P13984 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2F2P13984 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2F2P13984 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2F2P13984 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2F2P13984 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2F2P13984 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2F2P13984 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2F2P13984 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2F2P13984 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2F2P13984 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2F2P13984 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2F2P13984 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2F2P13984 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2F2P13984 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2F2P13984 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2F2P13984 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2F2P13984 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2F2P13984 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2F2P13984 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2F2P13984 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2F2P13984 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2F2P13984 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2F2P13984 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2F2P13984 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2F2P13984 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2F2P13984 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2F2P13984 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2F2P13984 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms