Protein–RNA interactions for Protein: P0DI80

SMIM6, Small integral membrane protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM6P0DI80 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM6P0DI80 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM6P0DI80 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM6P0DI80 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM6P0DI80 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM6P0DI80 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM6P0DI80 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM6P0DI80 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM6P0DI80 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM6P0DI80 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM6P0DI80 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM6P0DI80 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM6P0DI80 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM6P0DI80 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM6P0DI80 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM6P0DI80 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM6P0DI80 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM6P0DI80 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM6P0DI80 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM6P0DI80 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM6P0DI80 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM6P0DI80 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms