Protein–RNA interactions for Protein: P02656

APOC3, Apolipoprotein C-III, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC3P02656 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
APOC3P02656 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
APOC3P02656 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
APOC3P02656 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
APOC3P02656 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
APOC3P02656 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
APOC3P02656 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
APOC3P02656 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
APOC3P02656 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
APOC3P02656 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
APOC3P02656 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
APOC3P02656 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
APOC3P02656 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
APOC3P02656 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
APOC3P02656 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
APOC3P02656 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
APOC3P02656 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
APOC3P02656 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
APOC3P02656 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
APOC3P02656 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
APOC3P02656 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
APOC3P02656 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
APOC3P02656 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
APOC3P02656 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
APOC3P02656 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
APOC3P02656 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
APOC3P02656 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
APOC3P02656 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
APOC3P02656 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
APOC3P02656 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOC3P02656 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOC3P02656 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOC3P02656 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOC3P02656 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOC3P02656 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOC3P02656 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOC3P02656 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOC3P02656 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOC3P02656 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOC3P02656 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOC3P02656 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOC3P02656 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOC3P02656 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOC3P02656 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOC3P02656 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOC3P02656 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOC3P02656 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOC3P02656 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
APOC3P02656 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
APOC3P02656 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
APOC3P02656 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
APOC3P02656 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
APOC3P02656 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.3
APOC3P02656 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOC3P02656 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOC3P02656 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOC3P02656 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOC3P02656 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOC3P02656 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOC3P02656 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
APOC3P02656 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOC3P02656 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOC3P02656 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOC3P02656 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOC3P02656 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOC3P02656 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOC3P02656 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOC3P02656 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOC3P02656 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOC3P02656 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOC3P02656 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOC3P02656 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOC3P02656 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOC3P02656 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOC3P02656 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
APOC3P02656 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOC3P02656 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOC3P02656 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOC3P02656 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOC3P02656 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOC3P02656 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOC3P02656 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOC3P02656 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOC3P02656 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOC3P02656 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOC3P02656 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOC3P02656 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOC3P02656 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOC3P02656 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOC3P02656 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOC3P02656 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOC3P02656 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOC3P02656 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOC3P02656 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
APOC3P02656 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOC3P02656 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOC3P02656 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOC3P02656 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOC3P02656 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
APOC3P02656 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms