Protein–RNA interactions for Protein: O95926

SYF2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2O95926 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYF2O95926 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYF2O95926 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYF2O95926 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYF2O95926 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYF2O95926 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYF2O95926 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYF2O95926 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYF2O95926 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYF2O95926 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYF2O95926 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYF2O95926 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYF2O95926 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYF2O95926 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYF2O95926 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYF2O95926 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYF2O95926 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYF2O95926 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYF2O95926 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYF2O95926 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYF2O95926 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYF2O95926 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYF2O95926 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYF2O95926 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYF2O95926 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYF2O95926 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYF2O95926 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYF2O95926 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYF2O95926 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYF2O95926 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYF2O95926 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYF2O95926 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYF2O95926 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYF2O95926 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYF2O95926 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYF2O95926 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYF2O95926 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYF2O95926 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SYF2O95926 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYF2O95926 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYF2O95926 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYF2O95926 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYF2O95926 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYF2O95926 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYF2O95926 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYF2O95926 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYF2O95926 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYF2O95926 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYF2O95926 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYF2O95926 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYF2O95926 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYF2O95926 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYF2O95926 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYF2O95926 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYF2O95926 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYF2O95926 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYF2O95926 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYF2O95926 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYF2O95926 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYF2O95926 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYF2O95926 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYF2O95926 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYF2O95926 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYF2O95926 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYF2O95926 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYF2O95926 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYF2O95926 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYF2O95926 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYF2O95926 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYF2O95926 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYF2O95926 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYF2O95926 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SYF2O95926 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYF2O95926 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYF2O95926 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYF2O95926 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYF2O95926 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYF2O95926 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYF2O95926 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYF2O95926 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYF2O95926 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYF2O95926 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYF2O95926 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYF2O95926 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYF2O95926 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYF2O95926 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYF2O95926 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYF2O95926 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYF2O95926 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYF2O95926 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SYF2O95926 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYF2O95926 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYF2O95926 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYF2O95926 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SYF2O95926 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYF2O95926 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYF2O95926 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYF2O95926 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYF2O95926 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYF2O95926 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms