Protein–RNA interactions for Protein: O95630

STAMBP, STAM-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAMBPO95630 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
STAMBPO95630 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
STAMBPO95630 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
STAMBPO95630 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
STAMBPO95630 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
STAMBPO95630 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
STAMBPO95630 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
STAMBPO95630 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
STAMBPO95630 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
STAMBPO95630 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
STAMBPO95630 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
STAMBPO95630 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
STAMBPO95630 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
STAMBPO95630 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
STAMBPO95630 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
STAMBPO95630 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
STAMBPO95630 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
STAMBPO95630 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
STAMBPO95630 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
STAMBPO95630 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
STAMBPO95630 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
STAMBPO95630 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
STAMBPO95630 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
STAMBPO95630 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
STAMBPO95630 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
STAMBPO95630 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
STAMBPO95630 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
STAMBPO95630 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
STAMBPO95630 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
STAMBPO95630 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
STAMBPO95630 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
STAMBPO95630 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
STAMBPO95630 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
STAMBPO95630 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
STAMBPO95630 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
STAMBPO95630 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
STAMBPO95630 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
STAMBPO95630 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
STAMBPO95630 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
STAMBPO95630 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
STAMBPO95630 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
STAMBPO95630 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
STAMBPO95630 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
STAMBPO95630 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
STAMBPO95630 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
STAMBPO95630 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
STAMBPO95630 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
STAMBPO95630 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
STAMBPO95630 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
STAMBPO95630 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
STAMBPO95630 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
STAMBPO95630 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
STAMBPO95630 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
STAMBPO95630 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
STAMBPO95630 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
STAMBPO95630 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
STAMBPO95630 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
STAMBPO95630 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
STAMBPO95630 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
STAMBPO95630 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
STAMBPO95630 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
STAMBPO95630 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
STAMBPO95630 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
STAMBPO95630 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
STAMBPO95630 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
STAMBPO95630 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
STAMBPO95630 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
STAMBPO95630 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
STAMBPO95630 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
STAMBPO95630 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
STAMBPO95630 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
STAMBPO95630 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
STAMBPO95630 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
STAMBPO95630 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
STAMBPO95630 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
STAMBPO95630 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
STAMBPO95630 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
STAMBPO95630 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
STAMBPO95630 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
STAMBPO95630 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
STAMBPO95630 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
STAMBPO95630 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
STAMBPO95630 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
STAMBPO95630 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
STAMBPO95630 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
STAMBPO95630 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
STAMBPO95630 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
STAMBPO95630 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
STAMBPO95630 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
STAMBPO95630 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
STAMBPO95630 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
STAMBPO95630 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
STAMBPO95630 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
STAMBPO95630 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
STAMBPO95630 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
STAMBPO95630 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
STAMBPO95630 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
STAMBPO95630 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
STAMBPO95630 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
STAMBPO95630 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms