Protein–RNA interactions for Protein: O60575

SPINK4, Serine protease inhibitor Kazal-type 4, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINK4O60575 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPINK4O60575 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPINK4O60575 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPINK4O60575 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPINK4O60575 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPINK4O60575 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPINK4O60575 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPINK4O60575 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPINK4O60575 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPINK4O60575 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPINK4O60575 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPINK4O60575 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPINK4O60575 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPINK4O60575 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPINK4O60575 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPINK4O60575 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPINK4O60575 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPINK4O60575 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPINK4O60575 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPINK4O60575 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPINK4O60575 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPINK4O60575 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SPINK4O60575 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPINK4O60575 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPINK4O60575 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPINK4O60575 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPINK4O60575 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPINK4O60575 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPINK4O60575 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPINK4O60575 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPINK4O60575 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPINK4O60575 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPINK4O60575 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPINK4O60575 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPINK4O60575 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPINK4O60575 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPINK4O60575 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPINK4O60575 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPINK4O60575 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPINK4O60575 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPINK4O60575 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPINK4O60575 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPINK4O60575 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPINK4O60575 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPINK4O60575 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPINK4O60575 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPINK4O60575 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPINK4O60575 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPINK4O60575 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPINK4O60575 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPINK4O60575 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPINK4O60575 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPINK4O60575 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPINK4O60575 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPINK4O60575 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPINK4O60575 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPINK4O60575 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPINK4O60575 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPINK4O60575 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPINK4O60575 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPINK4O60575 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPINK4O60575 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPINK4O60575 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPINK4O60575 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SPINK4O60575 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SPINK4O60575 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPINK4O60575 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPINK4O60575 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPINK4O60575 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPINK4O60575 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPINK4O60575 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPINK4O60575 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPINK4O60575 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPINK4O60575 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPINK4O60575 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms