Protein–RNA interactions for Protein: O43805

SSNA1, Sjoegren syndrome nuclear autoantigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSNA1O43805 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SSNA1O43805 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SSNA1O43805 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SSNA1O43805 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SSNA1O43805 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SSNA1O43805 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SSNA1O43805 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SSNA1O43805 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SSNA1O43805 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SSNA1O43805 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SSNA1O43805 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSNA1O43805 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSNA1O43805 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSNA1O43805 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSNA1O43805 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSNA1O43805 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSNA1O43805 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms