Protein–RNA interactions for Protein: O15524

SOCS1, Suppressor of cytokine signaling 1, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS1O15524 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SOCS1O15524 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SOCS1O15524 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SOCS1O15524 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SOCS1O15524 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SOCS1O15524 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SOCS1O15524 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SOCS1O15524 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SOCS1O15524 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms