Protein–RNA interactions for Protein: A8MV65

VGLL3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL3A8MV65 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VGLL3A8MV65 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VGLL3A8MV65 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VGLL3A8MV65 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VGLL3A8MV65 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VGLL3A8MV65 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VGLL3A8MV65 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
VGLL3A8MV65 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VGLL3A8MV65 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VGLL3A8MV65 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
VGLL3A8MV65 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VGLL3A8MV65 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VGLL3A8MV65 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VGLL3A8MV65 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VGLL3A8MV65 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VGLL3A8MV65 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VGLL3A8MV65 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
VGLL3A8MV65 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
VGLL3A8MV65 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VGLL3A8MV65 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
VGLL3A8MV65 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
VGLL3A8MV65 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
VGLL3A8MV65 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
VGLL3A8MV65 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
VGLL3A8MV65 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
VGLL3A8MV65 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
VGLL3A8MV65 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
VGLL3A8MV65 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
VGLL3A8MV65 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VGLL3A8MV65 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VGLL3A8MV65 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VGLL3A8MV65 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VGLL3A8MV65 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VGLL3A8MV65 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VGLL3A8MV65 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VGLL3A8MV65 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VGLL3A8MV65 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VGLL3A8MV65 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VGLL3A8MV65 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VGLL3A8MV65 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VGLL3A8MV65 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VGLL3A8MV65 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VGLL3A8MV65 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VGLL3A8MV65 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VGLL3A8MV65 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VGLL3A8MV65 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VGLL3A8MV65 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VGLL3A8MV65 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VGLL3A8MV65 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VGLL3A8MV65 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VGLL3A8MV65 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VGLL3A8MV65 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VGLL3A8MV65 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VGLL3A8MV65 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VGLL3A8MV65 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VGLL3A8MV65 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VGLL3A8MV65 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VGLL3A8MV65 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VGLL3A8MV65 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VGLL3A8MV65 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VGLL3A8MV65 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VGLL3A8MV65 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VGLL3A8MV65 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VGLL3A8MV65 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VGLL3A8MV65 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VGLL3A8MV65 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VGLL3A8MV65 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VGLL3A8MV65 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VGLL3A8MV65 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VGLL3A8MV65 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VGLL3A8MV65 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VGLL3A8MV65 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VGLL3A8MV65 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VGLL3A8MV65 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VGLL3A8MV65 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VGLL3A8MV65 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VGLL3A8MV65 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VGLL3A8MV65 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VGLL3A8MV65 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VGLL3A8MV65 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VGLL3A8MV65 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VGLL3A8MV65 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VGLL3A8MV65 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VGLL3A8MV65 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VGLL3A8MV65 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VGLL3A8MV65 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VGLL3A8MV65 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VGLL3A8MV65 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VGLL3A8MV65 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VGLL3A8MV65 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VGLL3A8MV65 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VGLL3A8MV65 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VGLL3A8MV65 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VGLL3A8MV65 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VGLL3A8MV65 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VGLL3A8MV65 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VGLL3A8MV65 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VGLL3A8MV65 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VGLL3A8MV65 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VGLL3A8MV65 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms