Protein–RNA interactions for Protein: A8MRT5

NPIPB5, Nuclear pore complex-interacting protein family member B5, humanhuman

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB5A8MRT5 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPIPB5A8MRT5 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPIPB5A8MRT5 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPIPB5A8MRT5 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPIPB5A8MRT5 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPIPB5A8MRT5 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NPIPB5A8MRT5 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPIPB5A8MRT5 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPIPB5A8MRT5 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPIPB5A8MRT5 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPIPB5A8MRT5 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPIPB5A8MRT5 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NPIPB5A8MRT5 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NPIPB5A8MRT5 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NPIPB5A8MRT5 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NPIPB5A8MRT5 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NPIPB5A8MRT5 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NPIPB5A8MRT5 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NPIPB5A8MRT5 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NPIPB5A8MRT5 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NPIPB5A8MRT5 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NPIPB5A8MRT5 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NPIPB5A8MRT5 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NPIPB5A8MRT5 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NPIPB5A8MRT5 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NPIPB5A8MRT5 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NPIPB5A8MRT5 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPIPB5A8MRT5 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPIPB5A8MRT5 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPIPB5A8MRT5 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPIPB5A8MRT5 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPIPB5A8MRT5 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPIPB5A8MRT5 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPIPB5A8MRT5 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPIPB5A8MRT5 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPIPB5A8MRT5 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPIPB5A8MRT5 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPIPB5A8MRT5 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPIPB5A8MRT5 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPIPB5A8MRT5 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPIPB5A8MRT5 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NPIPB5A8MRT5 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPIPB5A8MRT5 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPIPB5A8MRT5 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPIPB5A8MRT5 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPIPB5A8MRT5 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NPIPB5A8MRT5 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPIPB5A8MRT5 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPIPB5A8MRT5 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPIPB5A8MRT5 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPIPB5A8MRT5 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPIPB5A8MRT5 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPIPB5A8MRT5 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPIPB5A8MRT5 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPIPB5A8MRT5 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPIPB5A8MRT5 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPIPB5A8MRT5 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPIPB5A8MRT5 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPIPB5A8MRT5 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPIPB5A8MRT5 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPIPB5A8MRT5 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPIPB5A8MRT5 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPIPB5A8MRT5 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPIPB5A8MRT5 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPIPB5A8MRT5 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPIPB5A8MRT5 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPIPB5A8MRT5 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPIPB5A8MRT5 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPIPB5A8MRT5 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPIPB5A8MRT5 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPIPB5A8MRT5 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPIPB5A8MRT5 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPIPB5A8MRT5 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPIPB5A8MRT5 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPIPB5A8MRT5 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPIPB5A8MRT5 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPIPB5A8MRT5 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPIPB5A8MRT5 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPIPB5A8MRT5 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPIPB5A8MRT5 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPIPB5A8MRT5 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPIPB5A8MRT5 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPIPB5A8MRT5 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPIPB5A8MRT5 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPIPB5A8MRT5 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPIPB5A8MRT5 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPIPB5A8MRT5 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NPIPB5A8MRT5 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPIPB5A8MRT5 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPIPB5A8MRT5 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPIPB5A8MRT5 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NPIPB5A8MRT5 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPIPB5A8MRT5 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPIPB5A8MRT5 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPIPB5A8MRT5 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPIPB5A8MRT5 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPIPB5A8MRT5 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NPIPB5A8MRT5 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPIPB5A8MRT5 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NPIPB5A8MRT5 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms