Protein–RNA interactions for Protein: A6NEY3

GOLGA6L3, Putative golgin subfamily A member 6-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L3A6NEY3 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLGA6L3A6NEY3 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLGA6L3A6NEY3 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLGA6L3A6NEY3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLGA6L3A6NEY3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLGA6L3A6NEY3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLGA6L3A6NEY3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLGA6L3A6NEY3 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLGA6L3A6NEY3 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLGA6L3A6NEY3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLGA6L3A6NEY3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GOLGA6L3A6NEY3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GOLGA6L3A6NEY3 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GOLGA6L3A6NEY3 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GOLGA6L3A6NEY3 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GOLGA6L3A6NEY3 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GOLGA6L3A6NEY3 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GOLGA6L3A6NEY3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GOLGA6L3A6NEY3 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GOLGA6L3A6NEY3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GOLGA6L3A6NEY3 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GOLGA6L3A6NEY3 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GOLGA6L3A6NEY3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GOLGA6L3A6NEY3 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA6L3A6NEY3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA6L3A6NEY3 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA6L3A6NEY3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA6L3A6NEY3 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA6L3A6NEY3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA6L3A6NEY3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA6L3A6NEY3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA6L3A6NEY3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA6L3A6NEY3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA6L3A6NEY3 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA6L3A6NEY3 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA6L3A6NEY3 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA6L3A6NEY3 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA6L3A6NEY3 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA6L3A6NEY3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA6L3A6NEY3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA6L3A6NEY3 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA6L3A6NEY3 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA6L3A6NEY3 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA6L3A6NEY3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GOLGA6L3A6NEY3 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GOLGA6L3A6NEY3 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GOLGA6L3A6NEY3 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GOLGA6L3A6NEY3 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GOLGA6L3A6NEY3 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GOLGA6L3A6NEY3 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GOLGA6L3A6NEY3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GOLGA6L3A6NEY3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GOLGA6L3A6NEY3 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GOLGA6L3A6NEY3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GOLGA6L3A6NEY3 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GOLGA6L3A6NEY3 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GOLGA6L3A6NEY3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GOLGA6L3A6NEY3 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GOLGA6L3A6NEY3 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GOLGA6L3A6NEY3 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GOLGA6L3A6NEY3 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GOLGA6L3A6NEY3 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GOLGA6L3A6NEY3 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GOLGA6L3A6NEY3 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GOLGA6L3A6NEY3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GOLGA6L3A6NEY3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GOLGA6L3A6NEY3 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GOLGA6L3A6NEY3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GOLGA6L3A6NEY3 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GOLGA6L3A6NEY3 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GOLGA6L3A6NEY3 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GOLGA6L3A6NEY3 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GOLGA6L3A6NEY3 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GOLGA6L3A6NEY3 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GOLGA6L3A6NEY3 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GOLGA6L3A6NEY3 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GOLGA6L3A6NEY3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GOLGA6L3A6NEY3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GOLGA6L3A6NEY3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GOLGA6L3A6NEY3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GOLGA6L3A6NEY3 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GOLGA6L3A6NEY3 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GOLGA6L3A6NEY3 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GOLGA6L3A6NEY3 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GOLGA6L3A6NEY3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GOLGA6L3A6NEY3 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GOLGA6L3A6NEY3 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GOLGA6L3A6NEY3 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GOLGA6L3A6NEY3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GOLGA6L3A6NEY3 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GOLGA6L3A6NEY3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GOLGA6L3A6NEY3 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GOLGA6L3A6NEY3 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GOLGA6L3A6NEY3 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GOLGA6L3A6NEY3 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GOLGA6L3A6NEY3 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GOLGA6L3A6NEY3 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GOLGA6L3A6NEY3 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GOLGA6L3A6NEY3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GOLGA6L3A6NEY3 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms