Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5P3

RAI2, Retinoic acid-induced protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAI2Q9Y5P3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RAI2Q9Y5P3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RAI2Q9Y5P3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RAI2Q9Y5P3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
RAI2Q9Y5P3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RAI2Q9Y5P3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RAI2Q9Y5P3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RAI2Q9Y5P3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
RAI2Q9Y5P3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27■■□□□ 1.91
RAI2Q9Y5P3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RAI2Q9Y5P3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RAI2Q9Y5P3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RAI2Q9Y5P3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RAI2Q9Y5P3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RAI2Q9Y5P3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RAI2Q9Y5P3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RAI2Q9Y5P3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RAI2Q9Y5P3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RAI2Q9Y5P3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RAI2Q9Y5P3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RAI2Q9Y5P3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RAI2Q9Y5P3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RAI2Q9Y5P3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RAI2Q9Y5P3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RAI2Q9Y5P3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RAI2Q9Y5P3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RAI2Q9Y5P3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RAI2Q9Y5P3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RAI2Q9Y5P3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RAI2Q9Y5P3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAI2Q9Y5P3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAI2Q9Y5P3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RAI2Q9Y5P3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RAI2Q9Y5P3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RAI2Q9Y5P3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RAI2Q9Y5P3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
RAI2Q9Y5P3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RAI2Q9Y5P3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
RAI2Q9Y5P3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RAI2Q9Y5P3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RAI2Q9Y5P3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RAI2Q9Y5P3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RAI2Q9Y5P3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RAI2Q9Y5P3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RAI2Q9Y5P3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RAI2Q9Y5P3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RAI2Q9Y5P3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
RAI2Q9Y5P3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RAI2Q9Y5P3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RAI2Q9Y5P3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RAI2Q9Y5P3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RAI2Q9Y5P3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RAI2Q9Y5P3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RAI2Q9Y5P3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
RAI2Q9Y5P3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RAI2Q9Y5P3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RAI2Q9Y5P3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RAI2Q9Y5P3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RAI2Q9Y5P3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RAI2Q9Y5P3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
RAI2Q9Y5P3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RAI2Q9Y5P3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RAI2Q9Y5P3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RAI2Q9Y5P3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
RAI2Q9Y5P3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RAI2Q9Y5P3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RAI2Q9Y5P3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RAI2Q9Y5P3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RAI2Q9Y5P3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RAI2Q9Y5P3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RAI2Q9Y5P3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RAI2Q9Y5P3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RAI2Q9Y5P3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RAI2Q9Y5P3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RAI2Q9Y5P3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RAI2Q9Y5P3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RAI2Q9Y5P3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RAI2Q9Y5P3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RAI2Q9Y5P3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RAI2Q9Y5P3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RAI2Q9Y5P3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RAI2Q9Y5P3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
RAI2Q9Y5P3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RAI2Q9Y5P3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAI2Q9Y5P3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAI2Q9Y5P3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RAI2Q9Y5P3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RAI2Q9Y5P3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RAI2Q9Y5P3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RAI2Q9Y5P3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RAI2Q9Y5P3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RAI2Q9Y5P3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RAI2Q9Y5P3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RAI2Q9Y5P3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RAI2Q9Y5P3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RAI2Q9Y5P3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RAI2Q9Y5P3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
RAI2Q9Y5P3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RAI2Q9Y5P3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RAI2Q9Y5P3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.5 ms