Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y478

PRKAB1, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB1Q9Y478 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRKAB1Q9Y478 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRKAB1Q9Y478 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRKAB1Q9Y478 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRKAB1Q9Y478 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRKAB1Q9Y478 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRKAB1Q9Y478 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRKAB1Q9Y478 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRKAB1Q9Y478 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRKAB1Q9Y478 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRKAB1Q9Y478 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRKAB1Q9Y478 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRKAB1Q9Y478 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRKAB1Q9Y478 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRKAB1Q9Y478 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRKAB1Q9Y478 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRKAB1Q9Y478 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRKAB1Q9Y478 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRKAB1Q9Y478 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRKAB1Q9Y478 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRKAB1Q9Y478 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRKAB1Q9Y478 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRKAB1Q9Y478 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRKAB1Q9Y478 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRKAB1Q9Y478 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRKAB1Q9Y478 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRKAB1Q9Y478 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRKAB1Q9Y478 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRKAB1Q9Y478 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRKAB1Q9Y478 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRKAB1Q9Y478 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRKAB1Q9Y478 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRKAB1Q9Y478 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRKAB1Q9Y478 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRKAB1Q9Y478 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PRKAB1Q9Y478 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRKAB1Q9Y478 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRKAB1Q9Y478 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRKAB1Q9Y478 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRKAB1Q9Y478 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRKAB1Q9Y478 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRKAB1Q9Y478 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRKAB1Q9Y478 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRKAB1Q9Y478 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRKAB1Q9Y478 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRKAB1Q9Y478 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRKAB1Q9Y478 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRKAB1Q9Y478 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRKAB1Q9Y478 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRKAB1Q9Y478 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRKAB1Q9Y478 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRKAB1Q9Y478 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRKAB1Q9Y478 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRKAB1Q9Y478 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRKAB1Q9Y478 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRKAB1Q9Y478 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRKAB1Q9Y478 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRKAB1Q9Y478 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRKAB1Q9Y478 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRKAB1Q9Y478 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRKAB1Q9Y478 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRKAB1Q9Y478 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRKAB1Q9Y478 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRKAB1Q9Y478 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRKAB1Q9Y478 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRKAB1Q9Y478 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRKAB1Q9Y478 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRKAB1Q9Y478 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRKAB1Q9Y478 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRKAB1Q9Y478 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRKAB1Q9Y478 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRKAB1Q9Y478 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRKAB1Q9Y478 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PRKAB1Q9Y478 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRKAB1Q9Y478 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRKAB1Q9Y478 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRKAB1Q9Y478 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRKAB1Q9Y478 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRKAB1Q9Y478 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRKAB1Q9Y478 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRKAB1Q9Y478 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRKAB1Q9Y478 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRKAB1Q9Y478 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRKAB1Q9Y478 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRKAB1Q9Y478 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRKAB1Q9Y478 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRKAB1Q9Y478 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRKAB1Q9Y478 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRKAB1Q9Y478 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRKAB1Q9Y478 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRKAB1Q9Y478 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PRKAB1Q9Y478 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRKAB1Q9Y478 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRKAB1Q9Y478 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRKAB1Q9Y478 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRKAB1Q9Y478 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRKAB1Q9Y478 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRKAB1Q9Y478 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRKAB1Q9Y478 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRKAB1Q9Y478 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms