Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I7

PIKFYVE, 1-phosphatidylinositol 3-phosphate 5-kinase, humanhuman

Predictions only

Length 2,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIKFYVEQ9Y2I7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PIKFYVEQ9Y2I7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PIKFYVEQ9Y2I7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PIKFYVEQ9Y2I7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PIKFYVEQ9Y2I7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PIKFYVEQ9Y2I7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PIKFYVEQ9Y2I7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PIKFYVEQ9Y2I7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PIKFYVEQ9Y2I7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PIKFYVEQ9Y2I7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PIKFYVEQ9Y2I7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PIKFYVEQ9Y2I7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PIKFYVEQ9Y2I7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PIKFYVEQ9Y2I7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PIKFYVEQ9Y2I7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PIKFYVEQ9Y2I7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PIKFYVEQ9Y2I7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PIKFYVEQ9Y2I7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PIKFYVEQ9Y2I7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PIKFYVEQ9Y2I7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PIKFYVEQ9Y2I7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PIKFYVEQ9Y2I7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PIKFYVEQ9Y2I7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PIKFYVEQ9Y2I7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PIKFYVEQ9Y2I7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PIKFYVEQ9Y2I7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PIKFYVEQ9Y2I7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PIKFYVEQ9Y2I7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PIKFYVEQ9Y2I7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PIKFYVEQ9Y2I7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PIKFYVEQ9Y2I7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PIKFYVEQ9Y2I7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PIKFYVEQ9Y2I7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PIKFYVEQ9Y2I7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PIKFYVEQ9Y2I7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PIKFYVEQ9Y2I7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PIKFYVEQ9Y2I7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PIKFYVEQ9Y2I7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PIKFYVEQ9Y2I7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PIKFYVEQ9Y2I7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PIKFYVEQ9Y2I7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PIKFYVEQ9Y2I7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PIKFYVEQ9Y2I7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PIKFYVEQ9Y2I7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PIKFYVEQ9Y2I7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PIKFYVEQ9Y2I7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PIKFYVEQ9Y2I7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PIKFYVEQ9Y2I7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PIKFYVEQ9Y2I7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PIKFYVEQ9Y2I7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PIKFYVEQ9Y2I7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PIKFYVEQ9Y2I7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PIKFYVEQ9Y2I7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PIKFYVEQ9Y2I7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PIKFYVEQ9Y2I7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PIKFYVEQ9Y2I7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PIKFYVEQ9Y2I7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PIKFYVEQ9Y2I7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PIKFYVEQ9Y2I7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PIKFYVEQ9Y2I7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PIKFYVEQ9Y2I7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PIKFYVEQ9Y2I7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PIKFYVEQ9Y2I7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PIKFYVEQ9Y2I7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PIKFYVEQ9Y2I7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
PIKFYVEQ9Y2I7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PIKFYVEQ9Y2I7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PIKFYVEQ9Y2I7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PIKFYVEQ9Y2I7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PIKFYVEQ9Y2I7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PIKFYVEQ9Y2I7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PIKFYVEQ9Y2I7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PIKFYVEQ9Y2I7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PIKFYVEQ9Y2I7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PIKFYVEQ9Y2I7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PIKFYVEQ9Y2I7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PIKFYVEQ9Y2I7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PIKFYVEQ9Y2I7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PIKFYVEQ9Y2I7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PIKFYVEQ9Y2I7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PIKFYVEQ9Y2I7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PIKFYVEQ9Y2I7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PIKFYVEQ9Y2I7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PIKFYVEQ9Y2I7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PIKFYVEQ9Y2I7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PIKFYVEQ9Y2I7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PIKFYVEQ9Y2I7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PIKFYVEQ9Y2I7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PIKFYVEQ9Y2I7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PIKFYVEQ9Y2I7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PIKFYVEQ9Y2I7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PIKFYVEQ9Y2I7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PIKFYVEQ9Y2I7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PIKFYVEQ9Y2I7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PIKFYVEQ9Y2I7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PIKFYVEQ9Y2I7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PIKFYVEQ9Y2I7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PIKFYVEQ9Y2I7 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PIKFYVEQ9Y2I7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PIKFYVEQ9Y2I7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms