Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y287

ITM2B, Integral membrane protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITM2BQ9Y287 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ITM2BQ9Y287 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ITM2BQ9Y287 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ITM2BQ9Y287 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ITM2BQ9Y287 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ITM2BQ9Y287 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ITM2BQ9Y287 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ITM2BQ9Y287 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ITM2BQ9Y287 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ITM2BQ9Y287 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ITM2BQ9Y287 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ITM2BQ9Y287 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
ITM2BQ9Y287 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ITM2BQ9Y287 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ITM2BQ9Y287 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ITM2BQ9Y287 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ITM2BQ9Y287 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ITM2BQ9Y287 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ITM2BQ9Y287 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ITM2BQ9Y287 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ITM2BQ9Y287 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ITM2BQ9Y287 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ITM2BQ9Y287 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ITM2BQ9Y287 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ITM2BQ9Y287 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ITM2BQ9Y287 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ITM2BQ9Y287 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ITM2BQ9Y287 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ITM2BQ9Y287 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ITM2BQ9Y287 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ITM2BQ9Y287 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ITM2BQ9Y287 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ITM2BQ9Y287 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ITM2BQ9Y287 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ITM2BQ9Y287 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ITM2BQ9Y287 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ITM2BQ9Y287 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ITM2BQ9Y287 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ITM2BQ9Y287 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ITM2BQ9Y287 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ITM2BQ9Y287 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ITM2BQ9Y287 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ITM2BQ9Y287 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ITM2BQ9Y287 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ITM2BQ9Y287 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ITM2BQ9Y287 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ITM2BQ9Y287 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ITM2BQ9Y287 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ITM2BQ9Y287 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ITM2BQ9Y287 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ITM2BQ9Y287 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ITM2BQ9Y287 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ITM2BQ9Y287 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
ITM2BQ9Y287 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITM2BQ9Y287 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITM2BQ9Y287 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
ITM2BQ9Y287 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITM2BQ9Y287 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITM2BQ9Y287 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITM2BQ9Y287 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ITM2BQ9Y287 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ITM2BQ9Y287 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ITM2BQ9Y287 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ITM2BQ9Y287 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ITM2BQ9Y287 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ITM2BQ9Y287 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ITM2BQ9Y287 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
ITM2BQ9Y287 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ITM2BQ9Y287 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ITM2BQ9Y287 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ITM2BQ9Y287 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ITM2BQ9Y287 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ITM2BQ9Y287 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ITM2BQ9Y287 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ITM2BQ9Y287 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ITM2BQ9Y287 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ITM2BQ9Y287 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ITM2BQ9Y287 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ITM2BQ9Y287 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ITM2BQ9Y287 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ITM2BQ9Y287 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ITM2BQ9Y287 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ITM2BQ9Y287 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ITM2BQ9Y287 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ITM2BQ9Y287 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
ITM2BQ9Y287 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ITM2BQ9Y287 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ITM2BQ9Y287 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ITM2BQ9Y287 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITM2BQ9Y287 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITM2BQ9Y287 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITM2BQ9Y287 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITM2BQ9Y287 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITM2BQ9Y287 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ITM2BQ9Y287 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ITM2BQ9Y287 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ITM2BQ9Y287 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ITM2BQ9Y287 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ITM2BQ9Y287 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ITM2BQ9Y287 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms