Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y235

APOBEC2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC2Q9Y235 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
APOBEC2Q9Y235 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
APOBEC2Q9Y235 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
APOBEC2Q9Y235 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
APOBEC2Q9Y235 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
APOBEC2Q9Y235 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
APOBEC2Q9Y235 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
APOBEC2Q9Y235 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
APOBEC2Q9Y235 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
APOBEC2Q9Y235 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
APOBEC2Q9Y235 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
APOBEC2Q9Y235 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
APOBEC2Q9Y235 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
APOBEC2Q9Y235 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
APOBEC2Q9Y235 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
APOBEC2Q9Y235 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
APOBEC2Q9Y235 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
APOBEC2Q9Y235 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
APOBEC2Q9Y235 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
APOBEC2Q9Y235 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
APOBEC2Q9Y235 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
APOBEC2Q9Y235 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
APOBEC2Q9Y235 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
APOBEC2Q9Y235 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
APOBEC2Q9Y235 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
APOBEC2Q9Y235 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
APOBEC2Q9Y235 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
APOBEC2Q9Y235 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
APOBEC2Q9Y235 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
APOBEC2Q9Y235 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
APOBEC2Q9Y235 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
APOBEC2Q9Y235 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
APOBEC2Q9Y235 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
APOBEC2Q9Y235 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
APOBEC2Q9Y235 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
APOBEC2Q9Y235 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
APOBEC2Q9Y235 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
APOBEC2Q9Y235 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
APOBEC2Q9Y235 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
APOBEC2Q9Y235 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
APOBEC2Q9Y235 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
APOBEC2Q9Y235 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
APOBEC2Q9Y235 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
APOBEC2Q9Y235 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
APOBEC2Q9Y235 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
APOBEC2Q9Y235 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
APOBEC2Q9Y235 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
APOBEC2Q9Y235 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
APOBEC2Q9Y235 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
APOBEC2Q9Y235 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
APOBEC2Q9Y235 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
APOBEC2Q9Y235 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
APOBEC2Q9Y235 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
APOBEC2Q9Y235 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
APOBEC2Q9Y235 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
APOBEC2Q9Y235 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
APOBEC2Q9Y235 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
APOBEC2Q9Y235 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
APOBEC2Q9Y235 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
APOBEC2Q9Y235 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
APOBEC2Q9Y235 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
APOBEC2Q9Y235 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
APOBEC2Q9Y235 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
APOBEC2Q9Y235 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
APOBEC2Q9Y235 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
APOBEC2Q9Y235 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
APOBEC2Q9Y235 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
APOBEC2Q9Y235 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
APOBEC2Q9Y235 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
APOBEC2Q9Y235 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
APOBEC2Q9Y235 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
APOBEC2Q9Y235 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
APOBEC2Q9Y235 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
APOBEC2Q9Y235 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
APOBEC2Q9Y235 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
APOBEC2Q9Y235 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
APOBEC2Q9Y235 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
APOBEC2Q9Y235 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
APOBEC2Q9Y235 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
APOBEC2Q9Y235 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
APOBEC2Q9Y235 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
APOBEC2Q9Y235 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
APOBEC2Q9Y235 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
APOBEC2Q9Y235 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
APOBEC2Q9Y235 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
APOBEC2Q9Y235 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
APOBEC2Q9Y235 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
APOBEC2Q9Y235 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
APOBEC2Q9Y235 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
APOBEC2Q9Y235 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
APOBEC2Q9Y235 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
APOBEC2Q9Y235 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
APOBEC2Q9Y235 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
APOBEC2Q9Y235 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
APOBEC2Q9Y235 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
APOBEC2Q9Y235 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
APOBEC2Q9Y235 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
APOBEC2Q9Y235 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
APOBEC2Q9Y235 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
APOBEC2Q9Y235 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms