Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
TRIM35Q9UPQ4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
TRIM35Q9UPQ4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
TRIM35Q9UPQ4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
TRIM35Q9UPQ4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
TRIM35Q9UPQ4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
TRIM35Q9UPQ4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
TRIM35Q9UPQ4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
TRIM35Q9UPQ4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
TRIM35Q9UPQ4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
TRIM35Q9UPQ4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
TRIM35Q9UPQ4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
TRIM35Q9UPQ4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
TRIM35Q9UPQ4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
TRIM35Q9UPQ4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
TRIM35Q9UPQ4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
TRIM35Q9UPQ4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
TRIM35Q9UPQ4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
TRIM35Q9UPQ4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
TRIM35Q9UPQ4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
TRIM35Q9UPQ4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
TRIM35Q9UPQ4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
TRIM35Q9UPQ4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
TRIM35Q9UPQ4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
TRIM35Q9UPQ4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
TRIM35Q9UPQ4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
TRIM35Q9UPQ4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC35■■■■□ 3.19
TRIM35Q9UPQ4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
TRIM35Q9UPQ4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
TRIM35Q9UPQ4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
TRIM35Q9UPQ4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
TRIM35Q9UPQ4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
TRIM35Q9UPQ4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
TRIM35Q9UPQ4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
TRIM35Q9UPQ4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC34.95■■■■□ 3.19
TRIM35Q9UPQ4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
TRIM35Q9UPQ4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
TRIM35Q9UPQ4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
TRIM35Q9UPQ4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
TRIM35Q9UPQ4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
TRIM35Q9UPQ4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
TRIM35Q9UPQ4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
TRIM35Q9UPQ4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC34.91■■■■□ 3.18
TRIM35Q9UPQ4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
TRIM35Q9UPQ4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
TRIM35Q9UPQ4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
TRIM35Q9UPQ4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
TRIM35Q9UPQ4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
TRIM35Q9UPQ4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
TRIM35Q9UPQ4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC34.87■■■■□ 3.17
TRIM35Q9UPQ4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
TRIM35Q9UPQ4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
TRIM35Q9UPQ4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
TRIM35Q9UPQ4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
TRIM35Q9UPQ4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
TRIM35Q9UPQ4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
TRIM35Q9UPQ4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
TRIM35Q9UPQ4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC34.83■■■■□ 3.17
TRIM35Q9UPQ4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.17
TRIM35Q9UPQ4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.17
TRIM35Q9UPQ4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
TRIM35Q9UPQ4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
TRIM35Q9UPQ4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
TRIM35Q9UPQ4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
TRIM35Q9UPQ4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
TRIM35Q9UPQ4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.8■■■■□ 3.16
TRIM35Q9UPQ4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
TRIM35Q9UPQ4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
TRIM35Q9UPQ4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC34.79■■■■□ 3.16
TRIM35Q9UPQ4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
TRIM35Q9UPQ4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
TRIM35Q9UPQ4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
TRIM35Q9UPQ4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
TRIM35Q9UPQ4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
TRIM35Q9UPQ4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC34.76■■■■□ 3.16
TRIM35Q9UPQ4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
TRIM35Q9UPQ4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
TRIM35Q9UPQ4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
TRIM35Q9UPQ4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
TRIM35Q9UPQ4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
TRIM35Q9UPQ4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
TRIM35Q9UPQ4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.74■■■■□ 3.15
TRIM35Q9UPQ4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
TRIM35Q9UPQ4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
TRIM35Q9UPQ4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
TRIM35Q9UPQ4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
TRIM35Q9UPQ4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
TRIM35Q9UPQ4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
TRIM35Q9UPQ4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
TRIM35Q9UPQ4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
TRIM35Q9UPQ4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
TRIM35Q9UPQ4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC34.68■■■■□ 3.14
TRIM35Q9UPQ4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
TRIM35Q9UPQ4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
TRIM35Q9UPQ4 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
TRIM35Q9UPQ4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
TRIM35Q9UPQ4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
TRIM35Q9UPQ4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
TRIM35Q9UPQ4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
TRIM35Q9UPQ4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms