Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNX7Q9UNH6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SNX7Q9UNH6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNX7Q9UNH6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNX7Q9UNH6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNX7Q9UNH6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNX7Q9UNH6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNX7Q9UNH6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNX7Q9UNH6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNX7Q9UNH6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNX7Q9UNH6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNX7Q9UNH6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNX7Q9UNH6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNX7Q9UNH6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNX7Q9UNH6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNX7Q9UNH6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNX7Q9UNH6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SNX7Q9UNH6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNX7Q9UNH6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SNX7Q9UNH6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNX7Q9UNH6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNX7Q9UNH6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNX7Q9UNH6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNX7Q9UNH6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNX7Q9UNH6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNX7Q9UNH6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNX7Q9UNH6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNX7Q9UNH6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNX7Q9UNH6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNX7Q9UNH6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNX7Q9UNH6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNX7Q9UNH6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNX7Q9UNH6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SNX7Q9UNH6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNX7Q9UNH6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNX7Q9UNH6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNX7Q9UNH6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNX7Q9UNH6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNX7Q9UNH6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SNX7Q9UNH6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SNX7Q9UNH6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SNX7Q9UNH6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNX7Q9UNH6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNX7Q9UNH6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SNX7Q9UNH6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SNX7Q9UNH6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SNX7Q9UNH6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SNX7Q9UNH6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNX7Q9UNH6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNX7Q9UNH6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNX7Q9UNH6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNX7Q9UNH6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNX7Q9UNH6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SNX7Q9UNH6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SNX7Q9UNH6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNX7Q9UNH6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNX7Q9UNH6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNX7Q9UNH6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNX7Q9UNH6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNX7Q9UNH6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNX7Q9UNH6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNX7Q9UNH6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNX7Q9UNH6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNX7Q9UNH6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNX7Q9UNH6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNX7Q9UNH6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNX7Q9UNH6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNX7Q9UNH6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNX7Q9UNH6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNX7Q9UNH6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNX7Q9UNH6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNX7Q9UNH6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNX7Q9UNH6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNX7Q9UNH6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNX7Q9UNH6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNX7Q9UNH6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNX7Q9UNH6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SNX7Q9UNH6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SNX7Q9UNH6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SNX7Q9UNH6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SNX7Q9UNH6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SNX7Q9UNH6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SNX7Q9UNH6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNX7Q9UNH6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNX7Q9UNH6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNX7Q9UNH6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNX7Q9UNH6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNX7Q9UNH6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNX7Q9UNH6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNX7Q9UNH6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNX7Q9UNH6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNX7Q9UNH6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SNX7Q9UNH6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNX7Q9UNH6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNX7Q9UNH6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNX7Q9UNH6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNX7Q9UNH6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SNX7Q9UNH6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNX7Q9UNH6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNX7Q9UNH6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms