Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKB1

FBXW11, F-box/WD repeat-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXW11Q9UKB1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
FBXW11Q9UKB1 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
FBXW11Q9UKB1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FBXW11Q9UKB1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
FBXW11Q9UKB1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FBXW11Q9UKB1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FBXW11Q9UKB1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
FBXW11Q9UKB1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FBXW11Q9UKB1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FBXW11Q9UKB1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
FBXW11Q9UKB1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
FBXW11Q9UKB1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FBXW11Q9UKB1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FBXW11Q9UKB1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FBXW11Q9UKB1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
FBXW11Q9UKB1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
FBXW11Q9UKB1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
FBXW11Q9UKB1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
FBXW11Q9UKB1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
FBXW11Q9UKB1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
FBXW11Q9UKB1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FBXW11Q9UKB1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
FBXW11Q9UKB1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FBXW11Q9UKB1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
FBXW11Q9UKB1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
FBXW11Q9UKB1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
FBXW11Q9UKB1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
FBXW11Q9UKB1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.14
FBXW11Q9UKB1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FBXW11Q9UKB1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FBXW11Q9UKB1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FBXW11Q9UKB1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FBXW11Q9UKB1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FBXW11Q9UKB1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
FBXW11Q9UKB1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FBXW11Q9UKB1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
FBXW11Q9UKB1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FBXW11Q9UKB1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
FBXW11Q9UKB1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FBXW11Q9UKB1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
FBXW11Q9UKB1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FBXW11Q9UKB1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
FBXW11Q9UKB1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
FBXW11Q9UKB1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
FBXW11Q9UKB1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
FBXW11Q9UKB1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FBXW11Q9UKB1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FBXW11Q9UKB1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FBXW11Q9UKB1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FBXW11Q9UKB1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
FBXW11Q9UKB1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FBXW11Q9UKB1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FBXW11Q9UKB1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FBXW11Q9UKB1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FBXW11Q9UKB1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FBXW11Q9UKB1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
FBXW11Q9UKB1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FBXW11Q9UKB1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FBXW11Q9UKB1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FBXW11Q9UKB1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FBXW11Q9UKB1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FBXW11Q9UKB1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FBXW11Q9UKB1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FBXW11Q9UKB1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FBXW11Q9UKB1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FBXW11Q9UKB1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FBXW11Q9UKB1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FBXW11Q9UKB1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FBXW11Q9UKB1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FBXW11Q9UKB1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FBXW11Q9UKB1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FBXW11Q9UKB1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FBXW11Q9UKB1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FBXW11Q9UKB1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
FBXW11Q9UKB1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FBXW11Q9UKB1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FBXW11Q9UKB1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
FBXW11Q9UKB1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FBXW11Q9UKB1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FBXW11Q9UKB1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FBXW11Q9UKB1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FBXW11Q9UKB1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FBXW11Q9UKB1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FBXW11Q9UKB1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FBXW11Q9UKB1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
FBXW11Q9UKB1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FBXW11Q9UKB1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FBXW11Q9UKB1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FBXW11Q9UKB1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FBXW11Q9UKB1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FBXW11Q9UKB1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FBXW11Q9UKB1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FBXW11Q9UKB1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FBXW11Q9UKB1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FBXW11Q9UKB1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FBXW11Q9UKB1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FBXW11Q9UKB1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FBXW11Q9UKB1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
FBXW11Q9UKB1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
FBXW11Q9UKB1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms