Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK05

GDF2, Growth/differentiation factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF2Q9UK05 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GDF2Q9UK05 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GDF2Q9UK05 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GDF2Q9UK05 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GDF2Q9UK05 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GDF2Q9UK05 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GDF2Q9UK05 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GDF2Q9UK05 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GDF2Q9UK05 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GDF2Q9UK05 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GDF2Q9UK05 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
GDF2Q9UK05 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GDF2Q9UK05 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GDF2Q9UK05 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GDF2Q9UK05 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GDF2Q9UK05 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GDF2Q9UK05 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GDF2Q9UK05 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GDF2Q9UK05 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GDF2Q9UK05 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GDF2Q9UK05 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GDF2Q9UK05 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GDF2Q9UK05 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GDF2Q9UK05 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GDF2Q9UK05 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GDF2Q9UK05 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GDF2Q9UK05 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GDF2Q9UK05 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GDF2Q9UK05 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GDF2Q9UK05 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GDF2Q9UK05 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GDF2Q9UK05 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GDF2Q9UK05 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GDF2Q9UK05 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GDF2Q9UK05 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GDF2Q9UK05 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GDF2Q9UK05 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GDF2Q9UK05 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GDF2Q9UK05 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GDF2Q9UK05 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GDF2Q9UK05 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GDF2Q9UK05 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GDF2Q9UK05 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GDF2Q9UK05 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GDF2Q9UK05 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GDF2Q9UK05 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GDF2Q9UK05 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GDF2Q9UK05 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GDF2Q9UK05 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GDF2Q9UK05 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GDF2Q9UK05 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GDF2Q9UK05 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GDF2Q9UK05 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GDF2Q9UK05 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GDF2Q9UK05 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GDF2Q9UK05 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDF2Q9UK05 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDF2Q9UK05 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDF2Q9UK05 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDF2Q9UK05 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDF2Q9UK05 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDF2Q9UK05 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDF2Q9UK05 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDF2Q9UK05 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDF2Q9UK05 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDF2Q9UK05 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GDF2Q9UK05 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GDF2Q9UK05 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GDF2Q9UK05 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GDF2Q9UK05 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GDF2Q9UK05 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GDF2Q9UK05 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GDF2Q9UK05 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GDF2Q9UK05 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GDF2Q9UK05 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GDF2Q9UK05 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GDF2Q9UK05 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GDF2Q9UK05 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
GDF2Q9UK05 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GDF2Q9UK05 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GDF2Q9UK05 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GDF2Q9UK05 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GDF2Q9UK05 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GDF2Q9UK05 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GDF2Q9UK05 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GDF2Q9UK05 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GDF2Q9UK05 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GDF2Q9UK05 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GDF2Q9UK05 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GDF2Q9UK05 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GDF2Q9UK05 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GDF2Q9UK05 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GDF2Q9UK05 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GDF2Q9UK05 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GDF2Q9UK05 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GDF2Q9UK05 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GDF2Q9UK05 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GDF2Q9UK05 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GDF2Q9UK05 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GDF2Q9UK05 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms