Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ7

SCP2D1, SCP2 sterol-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2D1Q9UJQ7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCP2D1Q9UJQ7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCP2D1Q9UJQ7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCP2D1Q9UJQ7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCP2D1Q9UJQ7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCP2D1Q9UJQ7 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCP2D1Q9UJQ7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCP2D1Q9UJQ7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCP2D1Q9UJQ7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCP2D1Q9UJQ7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SCP2D1Q9UJQ7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCP2D1Q9UJQ7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCP2D1Q9UJQ7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCP2D1Q9UJQ7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCP2D1Q9UJQ7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCP2D1Q9UJQ7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCP2D1Q9UJQ7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCP2D1Q9UJQ7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCP2D1Q9UJQ7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCP2D1Q9UJQ7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCP2D1Q9UJQ7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCP2D1Q9UJQ7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCP2D1Q9UJQ7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCP2D1Q9UJQ7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCP2D1Q9UJQ7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCP2D1Q9UJQ7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCP2D1Q9UJQ7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCP2D1Q9UJQ7 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCP2D1Q9UJQ7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCP2D1Q9UJQ7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCP2D1Q9UJQ7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCP2D1Q9UJQ7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCP2D1Q9UJQ7 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCP2D1Q9UJQ7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCP2D1Q9UJQ7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCP2D1Q9UJQ7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SCP2D1Q9UJQ7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCP2D1Q9UJQ7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCP2D1Q9UJQ7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCP2D1Q9UJQ7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCP2D1Q9UJQ7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCP2D1Q9UJQ7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCP2D1Q9UJQ7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCP2D1Q9UJQ7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCP2D1Q9UJQ7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCP2D1Q9UJQ7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCP2D1Q9UJQ7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCP2D1Q9UJQ7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCP2D1Q9UJQ7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCP2D1Q9UJQ7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCP2D1Q9UJQ7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCP2D1Q9UJQ7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCP2D1Q9UJQ7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCP2D1Q9UJQ7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCP2D1Q9UJQ7 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCP2D1Q9UJQ7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCP2D1Q9UJQ7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SCP2D1Q9UJQ7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCP2D1Q9UJQ7 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCP2D1Q9UJQ7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCP2D1Q9UJQ7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCP2D1Q9UJQ7 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCP2D1Q9UJQ7 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCP2D1Q9UJQ7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCP2D1Q9UJQ7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCP2D1Q9UJQ7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCP2D1Q9UJQ7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCP2D1Q9UJQ7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCP2D1Q9UJQ7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCP2D1Q9UJQ7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCP2D1Q9UJQ7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCP2D1Q9UJQ7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCP2D1Q9UJQ7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCP2D1Q9UJQ7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SCP2D1Q9UJQ7 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCP2D1Q9UJQ7 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCP2D1Q9UJQ7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCP2D1Q9UJQ7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCP2D1Q9UJQ7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCP2D1Q9UJQ7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCP2D1Q9UJQ7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCP2D1Q9UJQ7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCP2D1Q9UJQ7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCP2D1Q9UJQ7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCP2D1Q9UJQ7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCP2D1Q9UJQ7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCP2D1Q9UJQ7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCP2D1Q9UJQ7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCP2D1Q9UJQ7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCP2D1Q9UJQ7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCP2D1Q9UJQ7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCP2D1Q9UJQ7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCP2D1Q9UJQ7 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCP2D1Q9UJQ7 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCP2D1Q9UJQ7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCP2D1Q9UJQ7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCP2D1Q9UJQ7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCP2D1Q9UJQ7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCP2D1Q9UJQ7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCP2D1Q9UJQ7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms