Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ99

CDH22, Cadherin-22, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH22Q9UJ99 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CDH22Q9UJ99 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CDH22Q9UJ99 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CDH22Q9UJ99 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CDH22Q9UJ99 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CDH22Q9UJ99 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CDH22Q9UJ99 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CDH22Q9UJ99 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CDH22Q9UJ99 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CDH22Q9UJ99 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CDH22Q9UJ99 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CDH22Q9UJ99 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CDH22Q9UJ99 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CDH22Q9UJ99 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CDH22Q9UJ99 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CDH22Q9UJ99 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CDH22Q9UJ99 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CDH22Q9UJ99 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CDH22Q9UJ99 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CDH22Q9UJ99 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CDH22Q9UJ99 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CDH22Q9UJ99 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CDH22Q9UJ99 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CDH22Q9UJ99 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CDH22Q9UJ99 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CDH22Q9UJ99 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CDH22Q9UJ99 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CDH22Q9UJ99 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CDH22Q9UJ99 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CDH22Q9UJ99 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CDH22Q9UJ99 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CDH22Q9UJ99 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CDH22Q9UJ99 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CDH22Q9UJ99 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CDH22Q9UJ99 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CDH22Q9UJ99 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CDH22Q9UJ99 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CDH22Q9UJ99 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CDH22Q9UJ99 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CDH22Q9UJ99 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
CDH22Q9UJ99 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
CDH22Q9UJ99 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CDH22Q9UJ99 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CDH22Q9UJ99 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CDH22Q9UJ99 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CDH22Q9UJ99 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CDH22Q9UJ99 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CDH22Q9UJ99 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CDH22Q9UJ99 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CDH22Q9UJ99 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CDH22Q9UJ99 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CDH22Q9UJ99 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CDH22Q9UJ99 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CDH22Q9UJ99 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CDH22Q9UJ99 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CDH22Q9UJ99 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CDH22Q9UJ99 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CDH22Q9UJ99 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CDH22Q9UJ99 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CDH22Q9UJ99 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CDH22Q9UJ99 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CDH22Q9UJ99 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CDH22Q9UJ99 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CDH22Q9UJ99 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CDH22Q9UJ99 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CDH22Q9UJ99 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CDH22Q9UJ99 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CDH22Q9UJ99 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CDH22Q9UJ99 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CDH22Q9UJ99 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CDH22Q9UJ99 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CDH22Q9UJ99 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CDH22Q9UJ99 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDH22Q9UJ99 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CDH22Q9UJ99 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CDH22Q9UJ99 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDH22Q9UJ99 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDH22Q9UJ99 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDH22Q9UJ99 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CDH22Q9UJ99 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDH22Q9UJ99 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDH22Q9UJ99 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDH22Q9UJ99 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDH22Q9UJ99 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDH22Q9UJ99 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDH22Q9UJ99 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDH22Q9UJ99 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDH22Q9UJ99 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDH22Q9UJ99 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDH22Q9UJ99 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
CDH22Q9UJ99 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDH22Q9UJ99 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDH22Q9UJ99 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDH22Q9UJ99 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDH22Q9UJ99 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDH22Q9UJ99 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDH22Q9UJ99 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDH22Q9UJ99 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDH22Q9UJ99 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDH22Q9UJ99 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms