Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ6

SHPK, Sedoheptulokinase, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPKQ9UHJ6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHPKQ9UHJ6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHPKQ9UHJ6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHPKQ9UHJ6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHPKQ9UHJ6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHPKQ9UHJ6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHPKQ9UHJ6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHPKQ9UHJ6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHPKQ9UHJ6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHPKQ9UHJ6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHPKQ9UHJ6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHPKQ9UHJ6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHPKQ9UHJ6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHPKQ9UHJ6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHPKQ9UHJ6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SHPKQ9UHJ6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SHPKQ9UHJ6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SHPKQ9UHJ6 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SHPKQ9UHJ6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHPKQ9UHJ6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHPKQ9UHJ6 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SHPKQ9UHJ6 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SHPKQ9UHJ6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SHPKQ9UHJ6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHPKQ9UHJ6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHPKQ9UHJ6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHPKQ9UHJ6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHPKQ9UHJ6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHPKQ9UHJ6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHPKQ9UHJ6 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHPKQ9UHJ6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHPKQ9UHJ6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHPKQ9UHJ6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHPKQ9UHJ6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHPKQ9UHJ6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHPKQ9UHJ6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHPKQ9UHJ6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHPKQ9UHJ6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHPKQ9UHJ6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHPKQ9UHJ6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHPKQ9UHJ6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHPKQ9UHJ6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHPKQ9UHJ6 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHPKQ9UHJ6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHPKQ9UHJ6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SHPKQ9UHJ6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SHPKQ9UHJ6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHPKQ9UHJ6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHPKQ9UHJ6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SHPKQ9UHJ6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SHPKQ9UHJ6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SHPKQ9UHJ6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SHPKQ9UHJ6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SHPKQ9UHJ6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SHPKQ9UHJ6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SHPKQ9UHJ6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SHPKQ9UHJ6 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SHPKQ9UHJ6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SHPKQ9UHJ6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SHPKQ9UHJ6 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SHPKQ9UHJ6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SHPKQ9UHJ6 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SHPKQ9UHJ6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SHPKQ9UHJ6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SHPKQ9UHJ6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SHPKQ9UHJ6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SHPKQ9UHJ6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SHPKQ9UHJ6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SHPKQ9UHJ6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SHPKQ9UHJ6 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SHPKQ9UHJ6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SHPKQ9UHJ6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SHPKQ9UHJ6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SHPKQ9UHJ6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SHPKQ9UHJ6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SHPKQ9UHJ6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SHPKQ9UHJ6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SHPKQ9UHJ6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SHPKQ9UHJ6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SHPKQ9UHJ6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SHPKQ9UHJ6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SHPKQ9UHJ6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SHPKQ9UHJ6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SHPKQ9UHJ6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SHPKQ9UHJ6 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SHPKQ9UHJ6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SHPKQ9UHJ6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SHPKQ9UHJ6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SHPKQ9UHJ6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SHPKQ9UHJ6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SHPKQ9UHJ6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SHPKQ9UHJ6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SHPKQ9UHJ6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SHPKQ9UHJ6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SHPKQ9UHJ6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SHPKQ9UHJ6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SHPKQ9UHJ6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SHPKQ9UHJ6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SHPKQ9UHJ6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SHPKQ9UHJ6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms