Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CLIP2Q9UDT6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CLIP2Q9UDT6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
CLIP2Q9UDT6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CLIP2Q9UDT6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CLIP2Q9UDT6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CLIP2Q9UDT6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CLIP2Q9UDT6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
CLIP2Q9UDT6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CLIP2Q9UDT6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CLIP2Q9UDT6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CLIP2Q9UDT6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
CLIP2Q9UDT6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CLIP2Q9UDT6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CLIP2Q9UDT6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CLIP2Q9UDT6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
CLIP2Q9UDT6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
CLIP2Q9UDT6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CLIP2Q9UDT6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
CLIP2Q9UDT6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
CLIP2Q9UDT6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
CLIP2Q9UDT6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CLIP2Q9UDT6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
CLIP2Q9UDT6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CLIP2Q9UDT6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CLIP2Q9UDT6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CLIP2Q9UDT6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CLIP2Q9UDT6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CLIP2Q9UDT6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC31.45■■■□□ 2.63
CLIP2Q9UDT6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
CLIP2Q9UDT6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
CLIP2Q9UDT6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CLIP2Q9UDT6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CLIP2Q9UDT6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
CLIP2Q9UDT6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
CLIP2Q9UDT6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CLIP2Q9UDT6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
CLIP2Q9UDT6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CLIP2Q9UDT6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CLIP2Q9UDT6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC31.4■■■□□ 2.62
CLIP2Q9UDT6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC31.4■■■□□ 2.62
CLIP2Q9UDT6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CLIP2Q9UDT6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CLIP2Q9UDT6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
CLIP2Q9UDT6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
CLIP2Q9UDT6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
CLIP2Q9UDT6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
CLIP2Q9UDT6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
CLIP2Q9UDT6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
CLIP2Q9UDT6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
CLIP2Q9UDT6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
CLIP2Q9UDT6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC31.36■■■□□ 2.61
CLIP2Q9UDT6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
CLIP2Q9UDT6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
CLIP2Q9UDT6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
CLIP2Q9UDT6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CLIP2Q9UDT6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CLIP2Q9UDT6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
CLIP2Q9UDT6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC31.33■■■□□ 2.61
CLIP2Q9UDT6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
CLIP2Q9UDT6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
CLIP2Q9UDT6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CLIP2Q9UDT6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CLIP2Q9UDT6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
CLIP2Q9UDT6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
CLIP2Q9UDT6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
CLIP2Q9UDT6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
CLIP2Q9UDT6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
CLIP2Q9UDT6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
CLIP2Q9UDT6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CLIP2Q9UDT6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC31.26■■■□□ 2.6
CLIP2Q9UDT6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC31.26■■■□□ 2.59
CLIP2Q9UDT6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
CLIP2Q9UDT6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CLIP2Q9UDT6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CLIP2Q9UDT6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CLIP2Q9UDT6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CLIP2Q9UDT6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CLIP2Q9UDT6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CLIP2Q9UDT6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
CLIP2Q9UDT6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.59
CLIP2Q9UDT6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.59
CLIP2Q9UDT6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
CLIP2Q9UDT6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CLIP2Q9UDT6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CLIP2Q9UDT6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CLIP2Q9UDT6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CLIP2Q9UDT6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
CLIP2Q9UDT6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CLIP2Q9UDT6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CLIP2Q9UDT6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CLIP2Q9UDT6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
CLIP2Q9UDT6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
CLIP2Q9UDT6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
CLIP2Q9UDT6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CLIP2Q9UDT6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
CLIP2Q9UDT6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
CLIP2Q9UDT6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
CLIP2Q9UDT6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
CLIP2Q9UDT6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms