Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY5

LPAR3, Lysophosphatidic acid receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPAR3Q9UBY5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LPAR3Q9UBY5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LPAR3Q9UBY5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LPAR3Q9UBY5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LPAR3Q9UBY5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LPAR3Q9UBY5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LPAR3Q9UBY5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LPAR3Q9UBY5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LPAR3Q9UBY5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LPAR3Q9UBY5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LPAR3Q9UBY5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LPAR3Q9UBY5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LPAR3Q9UBY5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LPAR3Q9UBY5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LPAR3Q9UBY5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LPAR3Q9UBY5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LPAR3Q9UBY5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LPAR3Q9UBY5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LPAR3Q9UBY5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LPAR3Q9UBY5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LPAR3Q9UBY5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LPAR3Q9UBY5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LPAR3Q9UBY5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LPAR3Q9UBY5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LPAR3Q9UBY5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LPAR3Q9UBY5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LPAR3Q9UBY5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LPAR3Q9UBY5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LPAR3Q9UBY5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LPAR3Q9UBY5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LPAR3Q9UBY5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LPAR3Q9UBY5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LPAR3Q9UBY5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LPAR3Q9UBY5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LPAR3Q9UBY5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LPAR3Q9UBY5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LPAR3Q9UBY5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LPAR3Q9UBY5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LPAR3Q9UBY5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LPAR3Q9UBY5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LPAR3Q9UBY5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LPAR3Q9UBY5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LPAR3Q9UBY5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LPAR3Q9UBY5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LPAR3Q9UBY5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LPAR3Q9UBY5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LPAR3Q9UBY5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LPAR3Q9UBY5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LPAR3Q9UBY5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LPAR3Q9UBY5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LPAR3Q9UBY5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LPAR3Q9UBY5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LPAR3Q9UBY5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LPAR3Q9UBY5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LPAR3Q9UBY5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LPAR3Q9UBY5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LPAR3Q9UBY5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LPAR3Q9UBY5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LPAR3Q9UBY5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LPAR3Q9UBY5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LPAR3Q9UBY5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LPAR3Q9UBY5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LPAR3Q9UBY5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LPAR3Q9UBY5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LPAR3Q9UBY5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LPAR3Q9UBY5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LPAR3Q9UBY5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LPAR3Q9UBY5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LPAR3Q9UBY5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LPAR3Q9UBY5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LPAR3Q9UBY5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LPAR3Q9UBY5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LPAR3Q9UBY5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LPAR3Q9UBY5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LPAR3Q9UBY5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LPAR3Q9UBY5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LPAR3Q9UBY5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LPAR3Q9UBY5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LPAR3Q9UBY5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LPAR3Q9UBY5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LPAR3Q9UBY5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LPAR3Q9UBY5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LPAR3Q9UBY5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LPAR3Q9UBY5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LPAR3Q9UBY5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LPAR3Q9UBY5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LPAR3Q9UBY5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LPAR3Q9UBY5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LPAR3Q9UBY5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LPAR3Q9UBY5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LPAR3Q9UBY5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LPAR3Q9UBY5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LPAR3Q9UBY5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LPAR3Q9UBY5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LPAR3Q9UBY5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LPAR3Q9UBY5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LPAR3Q9UBY5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LPAR3Q9UBY5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LPAR3Q9UBY5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LPAR3Q9UBY5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.7 ms