Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBS0

RPS6KB2, Ribosomal protein S6 kinase beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB2Q9UBS0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPS6KB2Q9UBS0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPS6KB2Q9UBS0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPS6KB2Q9UBS0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPS6KB2Q9UBS0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPS6KB2Q9UBS0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPS6KB2Q9UBS0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPS6KB2Q9UBS0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPS6KB2Q9UBS0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPS6KB2Q9UBS0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPS6KB2Q9UBS0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPS6KB2Q9UBS0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPS6KB2Q9UBS0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPS6KB2Q9UBS0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPS6KB2Q9UBS0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPS6KB2Q9UBS0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPS6KB2Q9UBS0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPS6KB2Q9UBS0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPS6KB2Q9UBS0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPS6KB2Q9UBS0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RPS6KB2Q9UBS0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RPS6KB2Q9UBS0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPS6KB2Q9UBS0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPS6KB2Q9UBS0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPS6KB2Q9UBS0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPS6KB2Q9UBS0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPS6KB2Q9UBS0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPS6KB2Q9UBS0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPS6KB2Q9UBS0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RPS6KB2Q9UBS0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPS6KB2Q9UBS0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPS6KB2Q9UBS0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPS6KB2Q9UBS0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPS6KB2Q9UBS0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RPS6KB2Q9UBS0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPS6KB2Q9UBS0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPS6KB2Q9UBS0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPS6KB2Q9UBS0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPS6KB2Q9UBS0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPS6KB2Q9UBS0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPS6KB2Q9UBS0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPS6KB2Q9UBS0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPS6KB2Q9UBS0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPS6KB2Q9UBS0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPS6KB2Q9UBS0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPS6KB2Q9UBS0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPS6KB2Q9UBS0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPS6KB2Q9UBS0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPS6KB2Q9UBS0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPS6KB2Q9UBS0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPS6KB2Q9UBS0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPS6KB2Q9UBS0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPS6KB2Q9UBS0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPS6KB2Q9UBS0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPS6KB2Q9UBS0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPS6KB2Q9UBS0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RPS6KB2Q9UBS0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPS6KB2Q9UBS0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPS6KB2Q9UBS0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPS6KB2Q9UBS0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RPS6KB2Q9UBS0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPS6KB2Q9UBS0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPS6KB2Q9UBS0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPS6KB2Q9UBS0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPS6KB2Q9UBS0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPS6KB2Q9UBS0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPS6KB2Q9UBS0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RPS6KB2Q9UBS0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPS6KB2Q9UBS0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPS6KB2Q9UBS0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPS6KB2Q9UBS0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPS6KB2Q9UBS0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPS6KB2Q9UBS0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPS6KB2Q9UBS0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPS6KB2Q9UBS0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RPS6KB2Q9UBS0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPS6KB2Q9UBS0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPS6KB2Q9UBS0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPS6KB2Q9UBS0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RPS6KB2Q9UBS0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPS6KB2Q9UBS0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPS6KB2Q9UBS0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPS6KB2Q9UBS0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPS6KB2Q9UBS0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPS6KB2Q9UBS0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPS6KB2Q9UBS0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPS6KB2Q9UBS0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RPS6KB2Q9UBS0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPS6KB2Q9UBS0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPS6KB2Q9UBS0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPS6KB2Q9UBS0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPS6KB2Q9UBS0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPS6KB2Q9UBS0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPS6KB2Q9UBS0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPS6KB2Q9UBS0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPS6KB2Q9UBS0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPS6KB2Q9UBS0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPS6KB2Q9UBS0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RPS6KB2Q9UBS0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPS6KB2Q9UBS0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms