Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR1

UPB1, Beta-ureidopropionase, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPB1Q9UBR1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
UPB1Q9UBR1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
UPB1Q9UBR1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UPB1Q9UBR1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
UPB1Q9UBR1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UPB1Q9UBR1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UPB1Q9UBR1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UPB1Q9UBR1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UPB1Q9UBR1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UPB1Q9UBR1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
UPB1Q9UBR1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UPB1Q9UBR1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UPB1Q9UBR1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UPB1Q9UBR1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UPB1Q9UBR1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UPB1Q9UBR1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UPB1Q9UBR1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UPB1Q9UBR1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UPB1Q9UBR1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
UPB1Q9UBR1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UPB1Q9UBR1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UPB1Q9UBR1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UPB1Q9UBR1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UPB1Q9UBR1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UPB1Q9UBR1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UPB1Q9UBR1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UPB1Q9UBR1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UPB1Q9UBR1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UPB1Q9UBR1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UPB1Q9UBR1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UPB1Q9UBR1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UPB1Q9UBR1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
UPB1Q9UBR1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
UPB1Q9UBR1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UPB1Q9UBR1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UPB1Q9UBR1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UPB1Q9UBR1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
UPB1Q9UBR1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UPB1Q9UBR1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UPB1Q9UBR1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UPB1Q9UBR1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
UPB1Q9UBR1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UPB1Q9UBR1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UPB1Q9UBR1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UPB1Q9UBR1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UPB1Q9UBR1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UPB1Q9UBR1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UPB1Q9UBR1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UPB1Q9UBR1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UPB1Q9UBR1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UPB1Q9UBR1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UPB1Q9UBR1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UPB1Q9UBR1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UPB1Q9UBR1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UPB1Q9UBR1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UPB1Q9UBR1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UPB1Q9UBR1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UPB1Q9UBR1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UPB1Q9UBR1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UPB1Q9UBR1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UPB1Q9UBR1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UPB1Q9UBR1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UPB1Q9UBR1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UPB1Q9UBR1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UPB1Q9UBR1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UPB1Q9UBR1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UPB1Q9UBR1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UPB1Q9UBR1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UPB1Q9UBR1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UPB1Q9UBR1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
UPB1Q9UBR1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UPB1Q9UBR1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UPB1Q9UBR1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UPB1Q9UBR1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UPB1Q9UBR1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UPB1Q9UBR1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UPB1Q9UBR1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UPB1Q9UBR1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UPB1Q9UBR1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UPB1Q9UBR1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UPB1Q9UBR1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UPB1Q9UBR1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
UPB1Q9UBR1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UPB1Q9UBR1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UPB1Q9UBR1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UPB1Q9UBR1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UPB1Q9UBR1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UPB1Q9UBR1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UPB1Q9UBR1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UPB1Q9UBR1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UPB1Q9UBR1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
UPB1Q9UBR1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UPB1Q9UBR1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
UPB1Q9UBR1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UPB1Q9UBR1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UPB1Q9UBR1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UPB1Q9UBR1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UPB1Q9UBR1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UPB1Q9UBR1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UPB1Q9UBR1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms