Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN6

TNFRSF10D, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10D, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF10DQ9UBN6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNFRSF10DQ9UBN6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNFRSF10DQ9UBN6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNFRSF10DQ9UBN6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNFRSF10DQ9UBN6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TNFRSF10DQ9UBN6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNFRSF10DQ9UBN6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNFRSF10DQ9UBN6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TNFRSF10DQ9UBN6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNFRSF10DQ9UBN6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNFRSF10DQ9UBN6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNFRSF10DQ9UBN6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNFRSF10DQ9UBN6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNFRSF10DQ9UBN6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNFRSF10DQ9UBN6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNFRSF10DQ9UBN6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNFRSF10DQ9UBN6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNFRSF10DQ9UBN6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNFRSF10DQ9UBN6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNFRSF10DQ9UBN6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNFRSF10DQ9UBN6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNFRSF10DQ9UBN6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TNFRSF10DQ9UBN6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNFRSF10DQ9UBN6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNFRSF10DQ9UBN6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNFRSF10DQ9UBN6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNFRSF10DQ9UBN6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNFRSF10DQ9UBN6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNFRSF10DQ9UBN6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TNFRSF10DQ9UBN6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNFRSF10DQ9UBN6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNFRSF10DQ9UBN6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNFRSF10DQ9UBN6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNFRSF10DQ9UBN6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNFRSF10DQ9UBN6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNFRSF10DQ9UBN6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNFRSF10DQ9UBN6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNFRSF10DQ9UBN6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNFRSF10DQ9UBN6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TNFRSF10DQ9UBN6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNFRSF10DQ9UBN6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNFRSF10DQ9UBN6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNFRSF10DQ9UBN6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNFRSF10DQ9UBN6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNFRSF10DQ9UBN6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNFRSF10DQ9UBN6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNFRSF10DQ9UBN6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNFRSF10DQ9UBN6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TNFRSF10DQ9UBN6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNFRSF10DQ9UBN6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNFRSF10DQ9UBN6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNFRSF10DQ9UBN6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNFRSF10DQ9UBN6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TNFRSF10DQ9UBN6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNFRSF10DQ9UBN6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNFRSF10DQ9UBN6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNFRSF10DQ9UBN6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNFRSF10DQ9UBN6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNFRSF10DQ9UBN6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNFRSF10DQ9UBN6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNFRSF10DQ9UBN6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNFRSF10DQ9UBN6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNFRSF10DQ9UBN6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNFRSF10DQ9UBN6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNFRSF10DQ9UBN6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNFRSF10DQ9UBN6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNFRSF10DQ9UBN6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNFRSF10DQ9UBN6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNFRSF10DQ9UBN6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNFRSF10DQ9UBN6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNFRSF10DQ9UBN6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNFRSF10DQ9UBN6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TNFRSF10DQ9UBN6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNFRSF10DQ9UBN6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TNFRSF10DQ9UBN6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TNFRSF10DQ9UBN6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNFRSF10DQ9UBN6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNFRSF10DQ9UBN6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNFRSF10DQ9UBN6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNFRSF10DQ9UBN6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNFRSF10DQ9UBN6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNFRSF10DQ9UBN6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNFRSF10DQ9UBN6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNFRSF10DQ9UBN6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNFRSF10DQ9UBN6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNFRSF10DQ9UBN6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TNFRSF10DQ9UBN6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TNFRSF10DQ9UBN6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNFRSF10DQ9UBN6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNFRSF10DQ9UBN6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TNFRSF10DQ9UBN6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNFRSF10DQ9UBN6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNFRSF10DQ9UBN6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNFRSF10DQ9UBN6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNFRSF10DQ9UBN6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNFRSF10DQ9UBN6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNFRSF10DQ9UBN6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNFRSF10DQ9UBN6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNFRSF10DQ9UBN6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNFRSF10DQ9UBN6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms